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Enregistrement W4408848341 · doi:10.58837/chula.the.2024.342

The development of a differentiating of infected from vaccinated animals (diva) elisa to detect antibody against senecavirus a

2024· dissertation· en· W4408848341 sur OpenAlexaboutno aff
Parin Watcharavongtip

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDivaVirologyAntibodyImmunologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Senecavirus A (SVA) is the causative agent of porcine idiopathic vesicular disease (PIVD), a condition clinically indistinguishable from other vesicular diseases in pigs, such as foot and mouth disease (FMD). This similarity complicates differential diagnosis, impacting the global swine industry, including Thailand. Rapid and accurate diagnostic methods are essential for effective disease control. Therefore, developing a highly sensitive and specific diagnostic tool for detecting SVA infection is crucial for distinguishing it from other vesicular diseases and controlling its spread. In this study, we conducted a retrospective analysis of SVA emergence in diagnostic samples from 2010 to 2021 in Thailand, with the goal of developing serological diagnostic tools for SVA. These included enzyme-linked immunosorbent assays (ELISA), starting with the SVA VP1 ELISA followed by the differentiating infected from vaccinated animals (DIVA) ELISA to detect SVA antibodies in pig serum. We utilized baculovirus and Escherichia coli (E. coli) expression systems to produce the SVA VP1 structural protein (SP) and the SVA 3AB non-structural protein (NSP), which served as coating antigens in the ELISAs to evaluate the performance of different protein expression systems. Additionally, we developed a prototype colloidal gold nanoparticle-based Lateral Flow Immunochromatographic (LFI) strip test using SVA NSP to detect SVA antibodies. Our results revealed that the first detection of SVA in Thailand occurred in 2016, with Thai SVA isolates closely related to the Canadian strain (11-55910-3), sharing 85% identity in the SVA VP1 gene and, showing a more distant relationship to other strains. All three assays were optimized, validated, and demonstrated high sensitivity and specificity: SVA VP1 ELISA (baculovirus: 100% sensitivity, 96.67% specificity; E. coli: 96.67% sensitivity and specificity) and SVA DIVA ELISA (baculovirus: 96.67% sensitivity, 96.67% specificity; E. coli: 100% sensitivity, 93.33% specificity). The SVA LFI strip test showed 97.97% sensitivity, and 90% specificity compared to VNA, and 98.62% sensitivity and 86.79% specificity compared to ELISA. All assays showed no cross-reactivity with other viruses and demonstrated strong agreement. These findings highlight the emergence of SVA in Thailand and emphasize the development of reliable diagnostic tools for detecting SVA antibodies, which could be valuable for sero-surveillance, disease control, and managing SVA vaccination in future pig herds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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