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Enregistrement W4408874664 · doi:10.1101/2025.03.25.645289

Mitochondrial defects result in decreased susceptibility to echinocandins via the transcriptional regulator Pdr1 in <i>Candida glabrata</i>

2025· preprint· en· W4408874664 sur OpenAlexaff
Natalia Klimova, H. Patel, Frédéric Devaux, Bernard Turcotte

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquebioluminescence and chemiluminescence research
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEchinocandinsRegulatorCandida glabrataMitochondrionMicrobiologyBiologyAntifungalCell biologyGeneCaspofunginBiochemistryAmphotericin B

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT In the human fungal pathogen Candida glabrata , the transcription factor Pdr1 controls the expression of genes encoding drug efflux pumps such as Cdr1. Pdr1 also controls its own expression by binding to pleiotropic drug responsive elements (PDREs) located in its promoter. Increased resistance to the antifungal drugs azoles (e.g. fluconazole) is often due to gain-of-function mutations in PDR1 that render the factor hyperactive. Mitochondrial defects also result in increased resistance to azoles via Pdr1. Resistance to another class of antifungals, the echinocandins (e.g. micafungin), is generally due to mutations in the FKS1 and FKS2 genes that encode the catalytic subunit of 1,3-beta-D-glucan synthase, the echinocandin target. We have observed that mitochondrial defects also result in increased resistance to echinocandins and we have shown that this process is mediated by Pdr1. Mitochondrial defects result in increased levels of PDR1 mRNA. Overexpression of PDR1 by replacing its native promoter by the strong ADH1 promoter resulted in increased resistance to micafungin. However, mutations in PDR1 that decrease susceptibility to azoles generally have modest effects on echinocandin resistance. We randomly mutagenized the PDR1 gene and screened for mutants with altered resistance to micafungin. Single amino acid changes downstream of the DNA binding domain result in preferential resistance to micafungin as compared to fluconazole. We also show that auto-regulation of PDR1 expression is necessary for resistance to micafungin. One PDR1 mutant showed over 15-fold increased promoter activity in a PDRE-dependent manner. In summary, we have identified a novel role for the transcriptional regulator Pdr1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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