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Enregistrement W4408885831 · doi:10.22541/au.174307689.98463113/v1

Unique Population or Unique Species? Genetic Insights into the Pygmy Freshwater Crocodiles of Northern Australia

2025· preprint· en· W4408885831 sur OpenAlexaff
Katherine Brittain, Torre Muhlbach, Rui Cao, Jose L. Mijangos, Dean Yibarbuk, Ruchira Somaweera, Nancy N. FitzSimmons, Jaime Gongora

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFish Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensStantec (Canada)
Organismes subventionnairesNovo Nordisk Fonden
Mots-clésCrocodilePopulationBiologyEcologyGeographyFisheryDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

) in few elevated, rocky escarpment areas of the Northern Territory of Australia reach sexual maturity earlier and generally have an adult size half that of their downstream counterparts. There is debate over whether these "pygmy" or "dwarf" crocodile populations are the result of extreme phenotypic plasticity or the origins of a unique species through peripatric speciation. This debate is of conservation concern as these populations face immediate threats from invasive species and climate change, and species classification can affect conservation management strategies. We used mitochondrial DNA control region and cytochrome b sequences to investigate whether mtDNA haplotype variation supports any evidence of speciation between the pygmy and standard-size freshwater crocodiles. Additionally, we used genotyping by sequencing (dd-RADseq) to examine genetic clustering. Separated and concatenated control region and cytochrome b haplotypes were shared between pygmy and standard-size crocodile populations. Principle Component Analysis and STRUCTURE analyses on dd-RADseq data showed pygmy and standard-size crocodiles cluster by geographic location as much as by phenotype. We found no clear and objective genetic evidence to suggest that the pygmy freshwater crocodiles should be considered a separate species from any other population of the standard-size crocodiles. However, the isolation and environmental adaptability of these unique pygmy freshwater crocodile populations make them ecologically unique and valuable for conservation, and worth safeguarding against potential threats.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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