Box of Lessons: An Open Educational Resource for Exploring Biomolecular Structure and Function
Notice bibliographique
Résumé
Structure-function relationships are a core concept in many STEM disciplines. Most biology curricula introduce students to macromolecules, their building blocks, and other small molecules that play key roles in biological processes. However, the shapes, interactions, and functions of these molecules are often discussed using schematic diagrams, ignoring the vast amounts of three-dimensional structural and bioinformatics data freely available from public data resources. Keeping up with and incorporating the rapidly evolving data, tools, and resources in suitable, structure-function focused lessons can be time-consuming and challenging. A group of experienced biology, chemistry, and biochemistry educators collaboratively developed the "Box of Lessons" (BOL) to engage students and educators in authentic explorations, reinforcing disciplinary concepts, while developing skills in biomolecular visualization and use of public bioinformatics data resources and tools. The BOL consists of multimedia learning materials, ready-to-use, student- and educator-facing worksheets with teaching notes, aligned with ASBMB learning goals. Materials in this collection have been reviewed and piloted by undergraduate educators before its publication on PDB-101, as modular open educational resources. Educators are encouraged to select BOL elements relevant to their curricular context and adapt them to fit their students' needs and learning goals.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,096 | 0,029 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».