MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4408907619 · doi:10.1128/jvi.02267-24

A gp41 HR2 residue modulates the susceptibility of HIV-1 envelope glycoproteins to small molecule inhibitors targeting gp120

2025· article· en· W4408907619 sur OpenAlexafffund
Debashree Chatterjee, Ling Niu, Halima Medjahed, Shilei Ding, Mehdi Benlarbi, Étienne Bélanger, Jérémie Prévost, Hung-Ching Chen, William D. Tolbert, Amos B. Smith, Marzena Pazgier, Andrés Finzi

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthCanada Foundation for Innovation
Mots-clésResidue (chemistry)Gp41GlycoproteinBiologyBiochemistryHistidineAmino acidGeneticsEpitopeAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One characteristic of the HIV-1 CRF01_AE strain is that it contains a bulkier histidine residue at position 375 (H375) in its envelope glycoproteins (Env). This residue is part of the Phe43 cavity, where residue 43 of CD4 engages with gp120. It has been shown that H375 contributes to resistance against small molecule inhibitors targeting gp120. Residue 375 co-evolved with a few residues of the gp120 inner domain layers, and together they modulate the susceptibility of Env to small molecule gp120 inhibitors. Since residue 629 within the HR2 region of gp41 has also been proposed to have co-evolved with residue 375, we explored its role in the susceptibility of HIV-1 Env to two classes of small molecule gp120 inhibitors: the conformational blocker temsavir and the CD4-mimetic (CD4mc) BNM-III-170. Reversion of CRF01_AE isoleucine to a major clade methionine at position 629 had a significant but opposite impact on the susceptibility of the virus to temsavir and BNM-III-170. Mechanistically, this is associated with the capacity of residue 629 to modulate Env stability, as attested by its impact on cold inactivation. Overall, our results show how a single residue of HR2 contributes to the overall Env trimer stability and its susceptibility to gp120-targeted small molecule inhibitors.IMPORTANCECRF01_AE envelope glycoproteins (Env) have a well-conserved histidine at position 375. This residue is key in modulating the susceptibility of HIV-1 to small molecule Env inhibitors. Here, we report that a residue of the gp41 HR2 region affects Env trimer stability and its susceptibility to gp120-directed small molecule inhibitors. This work adds to our understanding of HIV-1 Env resistance to small molecule inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Virology→Même sujetHIV Research and Treatment→Travaux en français237 207→