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Enregistrement W4408914266 · doi:10.1101/2025.03.24.644787

Arabidopsis root lipid droplets are hubs for membrane homeostasis under heat stress, and triterpenoid synthesis and storage

2025· preprint· en· W4408914266 sur OpenAlexaff
Patricia Scholz, Janis Dabisch, Alyssa C. Clews, Philipp William Niemeyer, Ana Carolina Vilchez, Magdiel Sheng Satha Lim, Siqi Sun, Lea Hembach, Francine Dreier, Katharina Blersch, Lea M Preuß, Martin Bonin, Elena Lesch, Takashi Shimada, Jürgen Eirich, Iris Finkemeier, Katharina Gutbrod, Peter Dörmann, You Wang, Robert T. Mullen, Till Ischebeck

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArabidopsisHeat stressMembraneChemistryTriterpenoidCell biologyBotanyBiochemistryBiologyGeneStereochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Plant lipid droplets (LDs) and their associated proteins have numerous subcellular and physiological functions. While considerable progress has been made for LDs in many tissues, the function and composition of LDs in roots remains largely unexplored. We investigated the changes of the number of LDs and of the lipidome in heat-stressed Arabidopsis thaliana roots. Furthermore, we isolated root LDs from the Arabidopsis mutant trigalactosyldiacylglycerol 1-1 sugar dependent 1-4 and investigated their proteome and lipidome. Heat stress lead to a degradation of membrane lipids and an increase in TAGs and LDs. while, fatty acid SEs decreased, probably acting as precursors for acylated sterol glycosides. A variety of proteins were enriched in root LDs, which are thus far not described as LD proteins. Transient expression of these proteins in many cases confirmed their LD localization, for example of the triterpene biosynthetic enzymes thalianol synthase and marneral synthase. We could furthermore show that the educts and products of these enzymes are enriched in root LDs, too. We conclude that root LDs simultaneously act as a sink and source during heat stress-induced membrane remodeling. Furthermore, root LDs play a pivotal role in triperpene synthesis and storage, thereby highlighting LDs as hubs in specialized metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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