DNA gyrase inhibition by Ni(II)-Schiff base complexes via in silico molecular docking studies: Spectroscopic, DFT calculations and in vitro pharmacological assessment
Notice bibliographique
Résumé
The current world's life-threatening illnesses have amplified multidrug resistance infections, bringing about immune system mayhem, thus, the quest for novel antimicrobial compounds with a broad spectrum of action. Four Ni(II) complexes, [Ni( YB )Cl]·2H 2 O (C1) , [Ni( YB )Br]·H 2 O (C2) , [Ni( YB )NO 3 ]·3H 2 O (C3) , [Ni( YB )COOCH 3 ]·2H 2 O (C4) [ HYB = 4-[(1 E )- N -{2-[( Z )-(4-methoxybenzylidene)amino]ethyl}ethanimidoyl]benzene-1,3-diol], were synthesized. Analytical techniques like CHNS analysis, UV–Vis, FT-IR, molar conductance, XRD, 1 H NMR, and TGA/DTA were utilized for characterization. The calculated E HOMO – E LUMO energy gap and global reactivity descriptors of the compounds were performed by DFT calculations. The energy gap (Δ E ) = E HOMO – E HOMO for the studied compounds HYB , C3 , C4 , C1 , and C2 were found to be 1.736, 1.243, 1.221 1.217, and 1.193 eV respectively. The chelated complexes exhibited higher DPPH radical scavenging power than the corresponding free HYB ligand. Amongst the complexes, C2 displayed the highest scavenging ability (IC 50 = 2.59 ± 1.21 μM). Antimicrobial activities of the synthesized compounds were validated against bacterial strains: gram (+) E. faecalis and S. aureus ; gram (−) P. aeruginosa and K. pneumoniae ; and fungi: C. neoformans and C. albicans . C2 exhibited the most inhibition (MIC = 390.6 μg/mL) against P. aeruginosa and E. faecalis , while C1 acted as the most effective compound (MIC = 48.83 μ g/mL) against the fungi strains. The docking study illustrated the highest binding affinity of −7.30 kcal/mol by C2 with P. aeruginosa (PDB: 8BN6 ), and C1 for the C. neoformans with −6.04 kcal/mol (PDB ID: 7T08 ) binding sites. Potential binding modes around the receptor's active sites were predicted by the in silico molecular docking studies. • Functionalized ONN Schiff base ligand from resacetophenone and diamine derivative, and four complexes has been synthesized. • Spectroscopic structural were investigated by CHNS, UV–Vis, FT-IR, molar conductance, XRD, NMR, and TGA/DTA techniques. • Structural optimization of the HYB ligand and metal ( C1 - C4 ) complexes showing the metal-ligand bonds. • The in vitro antioxidant, antibacterial, and antifungal efficacy of the HYB and ( C1 - C4 ) complexes has been investigated. • Potential binding modes around the DNA enzyme receptors active sites were predicted by the in silico docking studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».