Platelet concentrates safety: a focus on the challenging pathogen Staphylococcus aureus—a narrative review
Notice bibliographique
Résumé
Background and Objective: Contamination of platelet concentrates (PCs) with Staphylococcus aureus (S. aureus) is a significant concern in transfusion medicine. This pathogen can escape detection during routine PC screening with culture methods and in rare occasions resist pathogen reduction treatment. The aim of this narrative review is to provide up-to-date information on the modulation of molecular mechanisms of S. aureus that impact the safety of PC transfusion patients. Methods: Retrospective and observational studies were searched in PubMed and Google Scholar from January 2014 to October 2024 with the terms: “platelet concentrates”, “bacterial contamination”, “Staphylococcus aureus”, “transcriptome analyses”, “virulence factors”, and “metabolic adaptation”. Furthermore, analysis of comparative transcriptome data of S. aureus grown in PCs vs. media was added to complement/support findings of the literature review. Key Content and Findings: The literature review and transcriptome data revealed interesting phenotypic and genotypic characteristics of S. aureus, including expression of virulence determinants and adoption of alternative metabolic pathways in the harsh PC storage niche, posing a threat for transfusion patients. Although PCs provide a unique and challenging environment for S. aureus with a combination of physiological stressors, host defenses, and limited nutrient availability, this bacterium has developed sophisticated strategies to interfere with platelet immunomodulatory factors, resist immune clearance, and adapt to difficult survival conditions. Transcriptome analysis showed that the PC storage environment triggers upregulation of S. aureus genes responsible for cell wall modification, capsule production, and biofilm formation, which protect the bacterium from platelet and plasma-derived antimicrobial peptides, and environmental stressors. Additionally, genes encoding for proteins involved in alternative metabolic pathways, like anaerobic fermentation and nutrient acquisition, are upregulated in PCs compared to media. Comparative RNA-seq analyses of S. aureus cultured in PCs vs. media indicate that this bacterium switches onto a quiescent state to survive challenging PC storage conditions by minimizing energy expenditure, altering metabolic pathways, and enhancing resistance to environmental stresses. Conclusions: S. aureus adaptation to the PC storage environment results in molecular modulation of key factors involved in persistence and pathogenicity, posing a challenge for detection and eradication in contaminated PC units, with a potential detrimental outcome for transfusion patients.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».