Comparison of ciprofloxacin and aminoglycoside susceptibility testing for ceftriaxone non-susceptible Enterobacterales by disk diffusion and VITEK 2 vs. broth microdilution using updated Clinical and Laboratory Standards Institute breakpoints
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Fluoroquinolones and aminoglycosides are potential treatment choices in the setting of increasingly multi-drug resistant Enterobacterales. The Clinical & Laboratory Standards Institute (CLSI) breakpoints for fluoroquinolones and aminoglycosides in the Enterobacterales were revised in 2019 and 2022, respectively. However, performance of existing widely used automated systems, such as the VITEK 2 AST-N391 card, has not been extensively tested for MDR isolates at these new breakpoints. OBJECTIVE: To assess performance of the new breakpoints for ciprofloxacin, gentamicin, and tobramycin on the VITEK 2 system (bioMérieux, France) and disk diffusion by comparing to broth microdilution for ceftriaxone nonsusceptible Enterobacterales. METHODS: Ninety-four ceftriaxone non-susceptible Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates were identified between January 2021-June 2023. Broth microdilution was used as the reference standard against which disk diffusion and VITEK 2 susceptibility testing were compared. For the Vitek 2, we used the AST-N391 card and interpreted the results according to the updated CLSI breakpoints. RESULTS: Overall, 22.3% of isolates were susceptible to ciprofloxacin by BMD. Compared to BMD, disk diffusion had an overall minor error rate of 7.4% (95%CI 3.0-14.7%) with 0 major or very major errors (97.5% CI 0-3.8%). For the VITEK 2, a minor error rate of 13.8% (95% CI 7.6-22.5%), major error rate 19.0% (95%CI 7.7-40.0%) and very major error rate 0% (97.5%CI 0-3.8%) was noted. By comparison, 69.1% and 56.4% of isolates were susceptible to gentamicin and tobramycin, respectively. Disk diffusion and the VITEK 2 system both correctly categorized 100% of gentamicin susceptible and non-susceptible isolates. For tobramycin, disk diffusion had a 3.2% rate of misclassification (all minor errors) and the VITEK 2 had 2.1% rate of misclassification (all minor errors). There were no major or very major errors. CONCLUSIONS: Our findings suggest that both disk diffusion and to a greater extent the AST-N391 card for the VITEK 2 system will overcall non-susceptibility according to current CLSI breakpoints for ciprofloxacin. By contrast, the existing AST-N391 VITEK 2 card can likely be used to correctly infer susceptibility to gentamicin and tobramycin.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».