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Enregistrement W4409014105 · doi:10.47371/mycosci.myc43169

Molecular phylogeny of four selected species of the strictly anamorphic genus <i>Thysanophora</i> using nuclear ribosomal DNA sequences

2002· article· en· W4409014105 sur OpenAlexfundno aff
Susumu Iwamoto, Seiji Tokumasu, Yoshihisa Suyama, Makoto Kakishima

Notice bibliographique

RevueMycoscience · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Agriculture, Forestry and FisheriesUniversity of AlbertaInstitute for Fermentation, Osaka
Mots-clésBiologyRibosomal DNAGenusPhylogeneticsRibosomal RNANuclear DNAMolecular phylogeneticsZoologyBotanyEvolutionary biologyMitochondrial DNAGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To estimate the phylogenetic position of the strictly anamorphic genus Thysanophora among the class Ascomycetes sensu Kirk et al. and to examine the phylogenetic relationships among T. penicillioides and other Thysanophora species, 18S and 28S rDNA (D1 and D2 regions) sequences of 22 strains of four known and two unidentified Thysanophora species were determined and phylogenetically analyzed. The 18S rDNA analysis suggested that all Thysanophora species examined were members of Eurotiomycetidae, Eurotiales, Trichocomaceae. The 28S rDNA analysis indicated that these species were clustered together with Chromocleista, Eupenicillium, Geosmithia, and Penicillium assignable to three subgenera – Aspergilloides, Furcatum, and Penicillium. In the Eupenicillium lineage, a monophyly of T. penicillioides, T. longispora, T. taxi, T. canadensis, and T. cf. canadensis was supported by comparatively high bootstrap values. However, the ex-type strain and two strains of T. longispora isolated in Japan were of different phylogenetic positions. Thysanophora sp. was positioned at the base of the Thysanophora clade, although it was not supported by significant bootstrap values. From the results of this study, we consider that two anamorphic genera, Penicillium and Thysanophora, are clearly distinct in morphology but that they are not phylogenetically separable.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,894
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,161 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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