Characterization of Canadian Neisseria meningitidis serogroup B isolates and factor-H binding protein expression, data from the Canadian Immunization Monitoring Program Active (IMPACT), 2013–2020
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Invasive meningococcal disease, caused by Neisseria meningitidis, remains a significant health threat. This study examined the genetic diversity of serogroup B (NmB) organisms and assessed the potential coverage offered by the MenB-FHbp vaccine, licensed for individuals aged 10-25 years. NmB vaccines have not yet been incorporated into most routine immunization programs in Canada, with the exception of campaigns to deal with specific outbreaks and targeted vaccination efforts for at-risk groups. METHODS: From 2013 to 2020, NmB strains causing invasive meningococcal disease were collected through the Canadian Immunization Monitoring Program ACTive surveillance network. Each isolate underwent analysis to determine clonal complex (CC) and factor-H binding protein peptide (fHbp), and fHbp surface expression using the Meningococcal Antigen Surface Expression (MEASURE) assay. RESULTS: Of 119 isolates analyzed, 118 coded for full-length fHbp. CC-269 (48 isolates) and CC-41/44 (42 isolates) represented 75.6 % of all isolates. fHbp peptide 15 was the most prevalent peptide up until 2015 (47.4-53.9 %) but declined to 0-22.1 % afterwards. Median fHbp surface expression overall was 4270 MFI (IQR 2132-14,462). Peptides 15 and 210 (both CC-269) had the highest fHbp surface expression: peptide 15 (median: 18,446, IQR: 14,462-22,170) and peptide 210 (median: 28,306, IQR 24,935-31,678). Notably, 90.8 % of isolates had fHbp surface expression at a level associated with MenB-FHbp protection. CONCLUSION: CC-269 and CC-41/44 predominated in 2013-2020. Notably, peptide 15, the most prevalent until 2015, declined significantly thereafter. The majority of isolates expressed fHbp at a level associated with vaccine-induced protection. A wider age authorization for the vaccine may result in increased prevention of NmB disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».