Rapid Detection of Carbapenemase-Producing Organisms Using a Luminescent Biosensor
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Carbapenemase-producing organisms (CPOs) pose an urgent global health threat due to their ability to inactivate carbapenems, a group of last resort antibiotics. Infections caused by these pathogens are associated with poor patient outcomes, high mortality rates, and added burden to infection prevention and control programs, making early detection vital to ensure optimal antimicrobial therapy and appropriate implementation of infection control practices. In this study, we report the application of a luminescent whole-cell biosensor for the rapid detection of CPOs. This biosensor provides positive test results within 2.5 hours, inclusive of setup time, and has been validated with a panel of laboratory and clinical isolates producing a diverse range of carbapenemases (KPC, NDM, IMP, VIM and OXA-48-like). The assay successfully identified all CPO isolates tested with a sensitivity of 100%, including strains producing weak OXA-48-like carbapenemases which are sometimes missed by currently used detection methods. The assay also demonstrated a specificity of 100 %, with all non-CPO clinical isolates testing negative under the optimized assay conditions. Due to the rapid time-to-positivity, minimal setup requirements, and high sensitivity, this test could serve as an attractive alternative to CPO detection methods currently employed by clinical microbiology labs, and could also facilitate CPO screening in other settings ( e.g., environmental, agricultural).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».