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Enregistrement W4409054941 · doi:10.1101/2025.03.30.644615

Zone Matcher: A climate-based web application for deployment and assisted migration of forest trees

2025· preprint· en· W4409054941 sur OpenAlexaff
Tal J. Shalev, Mark McClure, Nikolas Stevenson-Molnar, Gregory A. O’Neill, Tongli Wang, Joseph A. E. Stewart, Glenn T. Howe

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueRemote Sensing and LiDAR Applications
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSoftware deploymentWeb applicationComputer scienceForestryEnvironmental scienceEnvironmental resource managementGeographyWorld Wide WebSoftware engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Populations of forest trees are generally adapted to the climates they inhabit. The farther trees are moved from their local climates, the more long-term growth and survival tend to decrease. Current tree deployment and assisted migration rely on 'climate distance thresholds' (CDTs), which are climatic distances beyond which tree performance is considered unacceptable. Fixed zone systems, which have been used to guide deployment of native or orchard seedlots for more than 50 years, usually consist of contiguous geographic areas (zone units) divided into elevational bands (zones). In contrast, focal zone systems allow seed transfer among fixed zones that have similar climates. By using recent historical climates and future climate projections, focal zones can be used for current tree deployment or assisted migration. We developed a focal-zone system for the Pacific Northwest region of North America. First, we worked with stakeholders to select the base zones for the system. These consisted of geographic zone sets from Washington, Oregon, California, and Idaho/western Montana, and ecological zone sets from the U.S. and British Columbia. Second, by analyzing climate variation across the region, we developed a normalized Euclidean climate distance function consisting of nine climate variables from ClimateNA. Third, we inferred CDTs from analyses of climate variation within the base zones and from provenance tests. Fourth, we compared seed deployment areas using the fixed zone versus focal zone system, with and without assisted migration. Finally, we developed the Zone Matcher web application which implements our focal zone system. Across the region, we identified climate matches among 4,393 partially overlapping zones covering approximately 252 M ha. The unique area covered by these zones was about 167 M ha. Compared to fixed zones, our focal zone system increased the deployment area about 17- to 35-fold for the ecological zones and 70- to 300-fold for the geographic zones. This expands seed deployment options, allows more seedlots to be considered for a planting site, facilitates assisted migration, and simplifies sharing of seedlots among organizations. In addition to climate, seed transfer should also consider factors such as plantation soils, microtopography, and projections of competing vegetation, insects, diseases, and fire.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: Logiciel
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,123

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0370,012

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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