The ubiquitin E3 ligase Huwe1 facilitates viral and self RNA sensing by RIG-I-like receptors
Notice bibliographique
Résumé
Abstract RIG-I-like receptors (RLRs) are cytoplasmic RNA sensors that promote type I and type III interferon (IFN) production in response to RNA ligands of viral or endogenous origin. The RLR pathway is tightly regulated by dynamic post-translational modifications, including ubiquitination. Huwe1 is a HECT domain-containing giant ubiquitin E3 ligase that has not been implicated in the RLR or IFN pathway. Here, we investigated whether Huwe1 is required for type I IFN induction downstream of RLRs. We demonstrate that loss of Huwe1 severely attenuates the expression of IFN-β, IFN-λ1 and IFN-stimulated genes (ISGs) in ADAR1-deficient human cells and primary murine bone-marrow derived macrophages, in which unedited self RNAs that serve as RLR ligands accumulate. In addition, depletion of Huwe1 reduces the induction of type I and III IFNs upon transfection with synthetic viral RNA mimetics or infection with a picornavirus. Using proteomics, we identified several putative Huwe1 substrates, which include key components of the RLR pathway (MAVS, TRAFs). We demonstrate that these substrates interact with Huwe1 and that Huwe1 is essential for the activity of TRAF5 in type I IFN induction. Collectively, our results put Huwe1 on the map as an important ubiquitin E3 ligase in the RLR pathway and provide new insights into ubiquitin-dependent regulation of cell-intrinsic antiviral immune pathways.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».