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Enregistrement W4409067010 · doi:10.1101/2025.03.27.645708

The ubiquitin E3 ligase Huwe1 facilitates viral and self RNA sensing by RIG-I-like receptors

2025· preprint· en· W4409067010 sur OpenAlexaff
Timo Oosenbrug, Dennis Gravekamp, Adán Pinto-Fernández, Stefania Crotta, Katja Finsterbusch, Sander B. van der Kooij, Laurens R. ter Haar, Yanniek Asschert, Gilaine F.E. Kleian, Benedikt M. Kessler, Andreas Wack, Annemarthe G. van der Veen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensDiscovery Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUbiquitin ligaseUbiquitinRIG-IRNA ligaseRNAReceptorChemistryComputational biologyCell biologyDNA ligaseBiologyDNABiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract RIG-I-like receptors (RLRs) are cytoplasmic RNA sensors that promote type I and type III interferon (IFN) production in response to RNA ligands of viral or endogenous origin. The RLR pathway is tightly regulated by dynamic post-translational modifications, including ubiquitination. Huwe1 is a HECT domain-containing giant ubiquitin E3 ligase that has not been implicated in the RLR or IFN pathway. Here, we investigated whether Huwe1 is required for type I IFN induction downstream of RLRs. We demonstrate that loss of Huwe1 severely attenuates the expression of IFN-β, IFN-λ1 and IFN-stimulated genes (ISGs) in ADAR1-deficient human cells and primary murine bone-marrow derived macrophages, in which unedited self RNAs that serve as RLR ligands accumulate. In addition, depletion of Huwe1 reduces the induction of type I and III IFNs upon transfection with synthetic viral RNA mimetics or infection with a picornavirus. Using proteomics, we identified several putative Huwe1 substrates, which include key components of the RLR pathway (MAVS, TRAFs). We demonstrate that these substrates interact with Huwe1 and that Huwe1 is essential for the activity of TRAF5 in type I IFN induction. Collectively, our results put Huwe1 on the map as an important ubiquitin E3 ligase in the RLR pathway and provide new insights into ubiquitin-dependent regulation of cell-intrinsic antiviral immune pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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