Alternative splicing generates a Ribosomal Protein S24 isoform induced by neuroinflammation and neurodegeneration
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Neuroinflammation, particularly that involving reactive microglia, the brain’s resident immune cells, is implicated in the pathogenesis of major neurodegenerative diseases. However, early markers of this process are in high demand. Multiple studies have reported changes in ribosomal protein (RP) expression during neurodegeneration, but the significance of these changes remains unclear. Ribosomes are evolutionarily conserved protein synthesizing machines, and although commonly viewed as invariant, accumulating evidence suggest functional ribosome specialization through variation in their protein composition. By analyzing cell type-specific translating mRNAs from mouse brains, we identify distinct RP expression patterns between neurons, astrocytes, and microglia, including neuron-specific RPs, Rpl13a and Rps10 . We also observed complex expression relationships between RP paralogs and their canonical counterparts, suggesting regulated mechanisms for generating heterogeneous ribosomes. Analysis across brain regions revealed that Rplp0 and Rpl13a , commonly used normalization references, show heterogeneous expression, raising important methodological considerations for gene expression studies. Importantly, we show that Rps24 , an essential ribosome component that undergoes alternative splicing to produce protein variants with different C-termini, exhibits striking cell type-specific isoform expression in brain. The Rps24c isoform is predominantly expressed in microglia and is increased by neuroinflammation caused by aging, neurodegeneration, or inflammatory chemicals. We verify increased expression of S24-PKE, the protein variant encoded by Rps24c , in brains with Alzheimer’s disease, Parkinson’s disease, and Huntington’s disease, and relevant mouse models, using isoform-specific antibodies. These findings establish heterogeneous RP expression as a feature of brain cell types and identify Rps24c /S24-PKE as a novel marker for neuroinflammation and neurodegeneration.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».