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Enregistrement W4409107652 · doi:10.1117/12.3043835

Assessing the impact of a pre-processing pipeline on a tumor localization model in prostate MRI within a large multi-institutional dataset (NRG-GU005)

2025· article· en· W4409107652 sur OpenAlexaff
Stephanie Alley, Marion Tonneau, Damien Olivié, Clare M. Tempany, Peter L. Choyke, Baris I. Turkbey, Uulke A. van der Heide, Rodney J. Ellis, Thomas Boike, Daniel J. Pennington, Arthur Frazier, C.A. Lawton, Nelson Leong, Alina Mihai, Scott C. Morgan, Abhishek A. Solanki, Jeff M. Michalski, Felix Y. Feng, Howard Sandler, Cynthia Ménard, Samuel Kadoury

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensUniversité de MontréalPolytechnique Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPipeline (software)Computer scienceProstateMagnetic resonance imagingArtificial intelligenceMedicineRadiologyInternal medicineCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multi-parametric magnetic resonance imaging (mpMRI) is increasingly recognized as a valuable tool for characterizing prostate cancer, integrating T2-weighted (T2w), diffusion-weighted (DWI), and dynamic contrast-enhanced (DCE) imaging. Despite its high sensitivity in localizing tumors, the specificity of mpMRI was shown to be hindered by benign conditions that mimic cancerous tissue features. The aim of this study is to investigate the effect of a pre-processing pipeline integrating state-of-the-art registration, bias field correction and normalization tools. We validated this pre-processing pipeline on a large multi-site dataset of 468 patients from 109 institutions. After performing all pre-processing, tumor localization was determined using a model-based tumor localization approach that takes both multi-parametric MRI and prior clinical knowledge features as input. Results show deformable image registration yielded a significant improvement in tumor localization accuracy, both for the diameter analysis as well as the area under the curve comparison for the subset of patients with ground truth tumor delineations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,370 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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