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Enregistrement W4409109742 · doi:10.1136/jmg-2024-110463

Clinical utility of genome sequencing in autism: illustrative examples from a genomic research study

2025· article· en· W4409109742 sur OpenAlexafffund
Thanuja Selvanayagam, Ny Hoang, Ege Sarikaya, Jennifer Howe, Carolyn Russell, Alana Iaboni, Morgan Quirbach, Christian R. Marshall, Péter Szatmári, Evdokia Anagnostou, Jacob Vorstman, Dean M. Hartley, Stephen W. Scherer

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAutism Spectrum Disorder Research
Établissements canadiensCentre for Addiction and Mental HealthHolland Bloorview Kids Rehabilitation HospitalUniversity of TorontoSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenMcMaster University
Organismes subventionnairesCanada Foundation for InnovationAutism SpeaksNational Institute of Mental HealthOntario Genomics InstituteOntario Brain InstituteCanadian Institutes of Health ResearchSick Kids FoundationGenome CanadaMcLaughlin Centre, University of Toronto
Mots-clésMedical geneticsGenetic counselingAutismGenetic testingAutism spectrum disorderWhole genome sequencingPersonal genomicsGenomeGenomicsDNA sequencingGeneticsMedicineHuman geneticsComputational biologyBiologyPsychiatryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Genetics is an important contributor to autism spectrum disorder (ASD). Clinical guidelines endorse genetic testing in the medical workup of ASD, particularly tests that use whole genome sequencing (WGS) technology. While the clinical utility of genetic testing in ASD is demonstrated, the breadth of impact of results can depend on the variant and/or gene being reported. METHODS: We reviewed research results returned to families enrolled in our ASD WGS study between 2012 and 2023. For significant results, we grouped the outcome of each genetic finding into three outcome categories: (1) genetic diagnosis, (2) counselling benefits and (3) support to family. RESULTS: Out of 202 families who received genome sequencing results, 100 had at least one clinically relevant finding related to ASD. With detailed examples, we show that all significant results led to a genetic diagnosis and counselling benefits. CONCLUSION: Our findings show the relevance of genome sequencing in ASD and provide illustrative examples of how the information can be used.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,151
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,258
Tête enseignante GPT0,481
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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