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Enregistrement W4409122424 · doi:10.1002/chem.202500105

A Fluorescent Aptasensor for Sensitive and Selective Determination of Epigenetic Cancer Biomarker N<sup>1</sup>‐Methyladenosine in Urine Samples

2025· article· en· W4409122424 sur OpenAlexafffund
Esra Bağda, Efkan Bağda, Juewen Liu

Notice bibliographique

RevueChemistry - A European Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesUniversity of WaterlooNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaTürkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Kurumu
Mots-clésAptamerChemistryIsothermal titration calorimetryUrineBiosensorChromatographyDetection limitFluorescenceLoop-mediated isothermal amplificationBiochemistryDNAMolecular biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract N1‐methyladenosine (m1A) level in urine increases in the presence of cancer and is associated with the tumor size and stage. In the present study, we aimed to develop a method for rapid, sensitive and accurate determination of m1A in urine samples. The capture systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX) method was used to isolate aptamers that could selectively bind to m1A. We successfully isolated two sequences that have high selectivity toward m1A. The affinities against m1A were determined by isothermal titration calorimetry (ITC) and thioflavin T (ThT) assays. The N1MA1a aptamer has a Kd of 1.9±0.1 µm determined by the ThT assay and 0.75±0.04 µm determined by ITC. A strand‐displacement biosensor was designed by labeling the aptamer with a carboxy fluorescein (FAM) and hybridizing it with a quencher‐labeled complementary DNA strand. Using this biosensing system, m1A was detected with a detection limit of 1.9 µm. The system shows high selectivity to m1A and high tolerance to adenosine, cytidine, guanosine, thymidine, uridine and N6‐methyladenosine (m6A) as well as urine constituents at their real levels in urine. The sensor has been applied to five different human urine samples showing quantitative recovery values, which indicates practical potential of this aptamer‐based biosensor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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