Transcriptomic signatures associated with developmental transitions in the gill of lake sturgeon (Acipenser fulvescens)
Notice bibliographique
Résumé
The developmental transition from the larval to juvenile stage, represents one of the highest periods of mortality for many species of fish. Thus, understanding the factors that may influence susceptibility to environmental stressors at this vulnerable stage is likely to be important for predicting responses to environmental change. Here, we compared gill mRNA transcript abundance during this critical developmental transition in fish from two geographically distinct populations of lake sturgeon (Acipenser fulvescens) that experience highly divergent thermal environments. Throughout the developmental transition from the larval to juvenile stage (30 to 60 days post-fertilization), the 'colder' northern population exhibited differential expression of approximately twice as many transcripts as compared to their 'warmer' southern counterparts. Transcriptional modifications that were conserved across both populations during the transition from the larva to juvenile stage were involved in histone methylation, protein binding, and apoptotic signaling associated with cell death and turnover. The northern population, specifically, had increased changes associated with GTPase signaling activation, cell surface proteins, mitochondrial and epithelial development which may have contributed to the larger magnitude of transcriptional change in this population, compared to their southern counterparts. Together these findings demonstrate the impacts of transcriptional shifts in the gill during development in lake sturgeon, as well as the potential for population-specific developmental processes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».