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Enregistrement W4409143445 · doi:10.1098/rsos.241077

Analysis of the spatio-temporal dynamics of a Rho-GEF-H1-myosin activator-inhibitor reaction-diffusion system

2025· article· en· W4409143445 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueRoyal Society Open Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueNonlinear Dynamics and Pattern Formation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBritish Columbia Knowledge Development FundCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsEngineering and Physical Sciences Research CouncilCanada Foundation for Innovation
Mots-clésBistabilityOrdinary differential equationReaction–diffusion systemOdeSteady state (chemistry)Pattern formationLimit cycleBifurcationStatistical physicsPhysicsPhase planeInstabilityDiffusionMetastabilityNonlinear systemMathematical analysisDifferential equationLimit (mathematics)MechanicsMathematicsChemistryThermodynamics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study presents a detailed mathematical analysis of the spatio-temporal dynamics of the RhoA-GEF-H1-myosin signalling network, modelled as a coupled system of reaction-diffusion equations. By employing conservation laws and the quasi-steady state approximation, the dynamics is reduced to a tractable nonlinear system. First, we analyse the temporal system of ordinary differential equations (ODE) in the absence of spatial variation, characterizing stability, bifurcations and oscillatory behaviour through phase-plane analysis and bifurcation theory. As parameter values change, the temporal system transitions between stable dynamics; unstable steady states characterized by oscillatory dynamics; and co-existence between locally stable steady states, or co-existence between a locally stable steady state and a locally stable limit cycle. Second, we extend the analysis to the reaction-diffusion system by incorporating diffusion to the temporal ODE model, leading to a comprehensive study of Turing instabilities and spatial pattern formation. In particular, by adding appropriate diffusion to the temporal model: (i) the uniform steady state can be destabilized leading to the well-known Turing diffusion-driven instability (DDI); (ii) one of the uniform stable steady states in the bistable region can be driven unstable, while the other one remains stable, leading to the formation of travelling wave fronts; and (iii) a stable limit cycle can undergo DDI leading to the formation of spatial patterns. More importantly, the interplay between bistability and diffusion shows how travelling wavefronts can emerge, consistent with experimental observations of cellular contractility pulses. Theoretical results are supported by numerical simulations, providing key insights into the parameter spaces that govern pattern transitions and diffusion-driven instabilities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,894
Score d'incertitude au seuil0,573

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,004
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle