MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4409151213 · doi:10.1038/s41467-025-58202-w

Cryo-EM analyses unveil details of mechanism and targocil-II mediated inhibition of S. aureus WTA transporter TarGH

2025· article· en· W4409151213 sur OpenAlexafffund
Franco K.K. Li, Shaun C. Peters, L.J. Worrall, Tianjun Sun, Jinhong Hu, M. Vuckovic, Maya A. Farha, Armando Palacios, Nathanael A. Caveney, Eric D. Brown, N.C.J. Strynadka

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesBiological and Environmental ResearchBritish Columbia Knowledge Development FundOffice of ScienceCanadian Institutes of Health ResearchMitacsNational Institutes of HealthMichael Smith Health Research BCCIHR Skin Research Training CentreOregon Health and Science UniversityU.S. Department of Energy
Mots-clésPeptidoglycanBiochemistryATP hydrolysisTeichoic acidLipid IIStaphylococcus aureusActive siteATPaseChemistrySmall moleculeEffluxATP-binding cassette transporterBacteriaTransporterBiologyBiophysicsEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wall teichoic acid (WTA) is a polyol phosphate polymer that covalently decorates peptidoglycan of gram-positive bacteria, including Staphylococcus aureus. Central to WTA biosynthesis is flipping of lipid-linked precursors across the cell membrane by TarGH, a type V ABC transporter. Here, we present cryo-EM structures of S. aureus TarGH in the presence of targocil-II, a promising small-molecule lead with β-lactam antibiotic synergistic action. Targocil-II binds to the extracellular dimerisation interface of TarG, we suggest mimicking flipped but not yet released substrate. In absence of targocil-II and in complex with ATP analogue ATPγS, determined at 2.3 Å resolution, the ATPase active site is allosterically inhibited. This is due to a so far undescribed D-loop conformation, potentially minimizing spurious ATP hydrolysis in the absence of substrate. Targocil-II binding comparatively causes local and remote conformational changes through to the TarH active site, with the D-loop now optimal for ATP hydrolysis. These structures suggest an ability to modulate ATP hydrolysis in a WTA substrate dependent manner and a jammed ATPase cycle as the basis of the observed inhibition by targocil-II. The molecular insights provide an unprecedented basis for development of TarGH targeted therapeutics for treatment of multidrug-resistant S. aureus and other gram-positive bacterial infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature Communications→Même sujetAntibiotic Resistance in Bacteria→Travaux en français237 207→