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Enregistrement W4409162398 · doi:10.1128/jb.00078-25

<i>Bacillus subtilis</i> MurJ and Amj Lipid II flippases are not essential for growth

2025· article· en· W4409162398 sur OpenAlexaff
Kiera Englehart, Jonathan Dworkin

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensColumbia College
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésLipid IIFlippaseBiologyBacillus subtilisPeptidoglycanBiochemistryTransmembrane proteinMembrane proteinCell envelopeCytoplasmLipid bilayerCell biologyEnzymeGeneGeneticsMembraneBacteriaEscherichia coliPhospholipidPhosphatidylserine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Identification of the protein that mediates transbilayer transport of the undecaprenyl-pyrophosphate (Und-PP) linked peptidoglycan precursor Lipid II has long been a subject of investigation. Candidates belonging to both the MOP (multidrug/oligosaccharidyl-lipid/polysaccharide) and SEDS (shape, elongation, division and sporulation) families of transmembrane proteins have been proposed, exhibiting characteristics consistent with mediating this process, including genetic essentiality and biochemical activity. While MOP family proteins including MurJ are widely considered to be the primary Lipid II transporter, questions still remain including a role for the SEDS proteins in this process. We and others previously showed that a Bacillus subtilis strain lacking all four MurJ homologs is viable, thereby implicating a separate mode of Lipid II transport across the membrane. However, a subsequent report of synthetic essentiality between B. subtilis MurJ and the flippase Amj suggested that they are necessary and sufficient. Here, we show that this effect is alleviated by excess synthesis of the enzyme responsible for Und-PP production. Thus, the inviability of a murJ-amj double mutant strain is not due to the essentiality of these enzymes for flipping Lipid II but is instead most likely a consequence of a reduction of free Und-PP levels. This result is consistent with a non-MOP-dependent pathway for Lipid II transport across the cytoplasmic membrane to enable cell wall peptidoglycan synthesis. IMPORTANCE The assembly of peptidoglycan (PG), the typically essential polymer that provides structural integrity to bacterial cells, begins with the synthesis of the Lipid II monomer in the cytoplasm and along the cytoplasmic face of the inner membrane. Lipid II is then translocated across the membrane to the extracellular site of polymerization. The mechanistic basis for this process remains unclear, with genetic and/or biochemical evidence pointing to two different families of conserved membrane proteins. Here, we present genetic evidence that only one of these two families is essential in Bacillus subtilis .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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