Virulence and molecular characterization of <i>Blumeria graminis</i> isolates from wheat fields across Ontario
Notice bibliographique
Résumé
In Ontario, Canada, the prevalence and severity of powdery mildew (PM) disease caused by Blumeria graminis on wheat has been escalating. Continual monitoring of the effectiveness of PM-resistance genes (Pm) and the pathogen virulence spectrum in the field is essential for breeding durable resistance to control the disease. In 2021 and 2022, a total of 74 single-colony isolates of B. graminis were purified from field samples from 40 randomly selected wheat fields and greenhouses in Ontario, then tested for virulence on 24 single-Pm gene wheat lines. Compared to a previous survey in 2018–2019, the virulence frequencies to most Pm genes have increased over the years, including Pm1a, Pm1b, Pm1c, Pm2, Pm3a, Pm3f, Pm5a, Pm5d, Pm17, Pm30, Pm34, Pm35, Pm43, MlAG12 and NCAG13. Nevertheless, Pm12, Pm16, Pm21 and Pm37 each remained effective against all isolates. Nine genes (Pm1a, Pm1b, Pm1c, Pm3d, Pm4b, Pm25, Pm29, MlAG12 and NCAG13) were generally effective, with resistance to more than 80% of the isolates. The remaining 11 genes were ineffective, having susceptible reactions to 37–97% of the isolates. DNA sequences of 116 isolates (2018–2022) for the fragments of alternative oxidase (AOX), protein kinase A (PKA), protein phosphatase type 2A (PPA) and β-tubulin (bTUB) genes resulted in only four informative segregating single nucleotide polymorphisms (SNPs). The linkage disequilibrium analyses of these four SNPs suggested frequent genetic recombination. Additionally, network analyses of virulence phenotype data showed no genetic subdivision, suggesting B. graminis in the sampled area is likely a panmictic population.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».