Distinct routes of clonal progression in SF3B1-mutant myelodysplastic syndromes
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT: Myelodysplastic syndromes (MDS) are clonal stem cell disorders driven by heterogeneous genetic alterations leading to variable clinical course. MDS with splicing factor SF3B1 mutations is a distinct subtype with a favorable outcome. However, selected comutations induce poor prognosis and how these genetic lesions cooperate in human hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs) during disease progression is still unclear. Here, we integrated clinical and molecular profiling of patients with SF3B1 mutations with gene editing of primary and induced pluripotent stem cell-derived human HSPCs to show that high-risk comutations impart distinct effects on lineage programs of SF3B1-mutant HSPCs. Secondary RUNX1 or STAG2 mutations were clinically associated with advanced disease and reduced survival. However, RUNX1 and STAG2 mutations induced opposing regulation of myeloid transcriptional programs and differentiation in SF3B1-mutant HSPCs. Moreover, high-risk RUNX1 and STAG2, but not low-risk TET2, mutations expanded distinct SF3B1-mutant HSPC subpopulations. These findings provide evidence that progression from low- to high-risk MDS involves distinct molecular and cellular routes depending on comutation patterns.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».