MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4409210754 · doi:10.1038/s41598-025-95590-x

The role of genetic testing in accurate diagnosis of X-linked sideroblastic anemia: novel ALAS2 mutations and the impact of X-chromosome inactivation

2025· article· en· W4409210754 sur OpenAlexaff
Daniel Jové-Solavera, Marta Rámila, Xènia Ferrer-Cortés, Mireia Olivella, Veronica Venturi, Marta Morado, Inés Hernández‐Rodríguez, Aneal Khan, Santiago Pérez-Montero, Cristian Tornador, Ulrich Germing, Norbert Gattermann, Mayka Sánchez

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePorphyrin Metabolism and Disorders
Établissements canadiensInstitute of Genetics
Organismes subventionnairesAgencia Estatal de InvestigaciónJosé Carreras Leukämie-StiftungMinisterio de Ciencia e Innovación
Mots-clésSideroblastic anemiaGeneticsX chromosomeGenetic testingBiologyMutationComputational biologyBioinformaticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

X-linked sideroblastic anemia (XLSA) is a hereditary disorder affecting heme biosynthesis, caused by mutations in the ALAS2 gene, which encodes the erythroid-specific enzyme 5-aminolevulinate synthase. This enzyme, which requires pyridoxal 5'-phosphate (PLP) as a cofactor, catalyzes the first and rate-limiting step of heme synthesis in erythroid cells. XLSA is characterized by hypochromic microcytic anemia and ring sideroblasts in bone marrow, with most patients showing variable degrees of response to pyridoxine supplementation; however, female carriers of ALAS2 mutations often present a distinct clinical phenotype. A comprehensive review of the literature reveals over 100 distinct ALAS2 mutations linked to XLSA in more than 240 families. Here, we report seven new patients (four female cases) initially diagnosed with various conditions, later confirmed to have X-linked Sideroblastic Anemia due to ALAS2 mutations through genetic analysis. Among these, five represent novel ALAS2 mutations, including the first ever reported stop-loss mutation in ALAS2 associated with XLSA rather than X-linked dominant protoporphyria (XLDPP). Computational modelling of six reported cases revealed that four mutations significantly impact protein structure, conformation and cofactor interaction, consistent with our enzymatic assays demonstrating reduced ALAS2 activity. Furthermore, X-chromosome studies in female probands revealed a pronounced skewing of X-chromosome, which may provide an explanation for their distinct clinical manifestations in females.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,400
Score d'incertitude au seuil0,213

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScientific ReportsMême sujetPorphyrin Metabolism and DisordersTravaux en français237 207