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Enregistrement W4409219289 · doi:10.1016/j.cancergen.2025.04.001

Analytical validation of the Belay Vantage™ assay for evaluation of MGMT promoter methylation using enzymatically converted tumorDNA from cerebrospinal fluid

2025· article· en· W4409219289 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCancer Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensBell (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésCerebrospinal fluidMethylationChromatographyChemistryMolecular biologyComputational biologyBiologyCancer researchMedicinePathologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

• Novel application - The Belay Vantage™ assay evaluates MGMT promoter methylation status in cerebrospinal fluid (CSF) of individuals with known or suspected central nervous system tumors using low input DNA (current methods are limited to tumor tissue). • Improved methodology – The test uses enzymatic conversion of DNA which does not affect the integrity of the DNA, minimizing damage, increasing ability to process converted DNA downstream (current commercial tests use bisulfite conversation which causes DNA damage). • Additional Content – Vantage™ evaluates 12 CpG sites in the MGMT promoter compared to only 4-8 sites that other commercial tests do. MGMT promoter methylation status (hypermethylation) is one of the strongest prognostic and predictive biomarkers in glioblastoma (GBM) and is associated with a more favorable response to alkylating chemotherapies such as Temozolomide (TMZ). Additionally, it is associated with pseudo progression in GBM, a phenomenon in which early radiographic changes after treatment are indicative of possible tumor recurrence though on histological examination it is consistent with treatment effect. Current methods for evaluation of MGMT promoter methylation status are limited to tumor tissue, requiring invasive biopsy or surgery, prompting the need for a liquid biopsy-based assay to expand and manage therapeutic interventions. The Belay Vantage™ assay evaluates MGMT promoter methylation status in cerebrospinal fluid (CSF) of individuals with known or suspected central nervous system tumors using low input DNA. The assay uses quantitative polymerase chain reaction (qPCR) on DNA extracted from CSF after enzymatic conversion and has an analytical sensitivity of 95.5 % and specificity of 100 %.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,371
Score d'incertitude au seuil0,288

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle