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Enregistrement W4409249839 · doi:10.3390/fermentation11040198

Two-Step Bio-Based Production of Heme: In Vivo Cell Cultivation Followed by In Vitro Enzymatic Conversion

2025· article· en· W4409249839 sur OpenAlexafffund
Bahareh Sadat Arab, Murray Moo‐Young, Yilan Liu, C. Perry Chou

Notice bibliographique

RevueFermentation · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePorphyrin Metabolism and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésIn vivoEnzymeIn vitroHemeProduction (economics)BiochemistryChemistryBiotechnologyBiologyEconomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heme is a chemical compound crucial for various biological processes and industrial applications. However, the microbial production of heme is often limited by its intracellular accumulation and associated toxicity. To address this, we employed a two-step approach involving in vivo cell cultivation for the production of a heme precursor (coproporphyrin III or coproheme) followed by its in vitro conversion(s) to heme. For the first step, we engineered Escherichia coli strains by implementing the coproporphyrin-dependent (CPD) pathway for bacterial cell cultivation, extracellularly producing up to 251 mg/L coproporphyrin III and 85 mg/L coproheme, respectively. For the second step, we cloned the hemH and hemQ genes for expression in E. coli, and the expressed gene products, i.e., coproheme decarboxylase (ChdC/HemH) and heme synthase (HemQ), were purified. Using the purified enzymes with modulated reaction conditions, we achieved up to a 77.2% yield to convert coproporphyrin III to coproheme and a 45.8% yield to convert coproheme to heme. This in vitro approach not only bypassed the intracellular toxicity constraint associated with in vivo cell cultivation but also enabled precise reaction control, leading to a higher efficiency and yield for heme (and coproheme) production. By applying novel strategies in strain engineering and bioprocessing to overcome inherent bioprocess challenges, this study paves the way for industrial biotechnology for the sustainable, efficient, and even large-scale bio-based production of heme.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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