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Enregistrement W4409277217 · doi:10.1101/2025.04.07.647535

Enteric Viruses and Free-Living Amoebae: Protozoa as Potential Reservoirs and Transport Vessels for human Norovirus and Adenovirus

2025· preprint· en· W4409277217 sur OpenAlexafffund
Mats Leifels, Rafik Dey, Alyssa Wiedmeyer, Claudia Kolm, Fuqing Wu, Kwanrawee Sirikanchana, Andreas H. Farnleitner, Nicholas J. Ashbolt

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesResearch School, Ruhr University BochumNational Research Foundation SingaporeAlberta InnovatesNational Research Foundation
Mots-clésNorovirusProtozoaVirologyBiologyMurine norovirusMicrobiologyVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Human norovirus (HNoV) and human adenovirus (HAdV) are major causes of acute viral gastroenteritis globally and environmentally transmitted via the faecal-oral route through contaminated food and water. Recent evidence of these enteric viruses residing within environmental free-living amoebae (FLA)—specifically Vermamoeba vermiformis, Acanthamoeba polyphaga, and Willaertia magna—has significant implications for environmental virology and public health. The incorporation of HNoV into the cytoplasm and vacuoles of V. vermiformis and A. polyphaga, as well as the nuclear localization of HAdV within W. magna, was demonstrated using quantitative PCR and fluorescence microscopy. Intact HNoV and HAdV virions persisted inside FLA trophozoites, cysts, and extracellular vesicles for up to 12 days. Moreover, HAdV retained infectivity in buffalo green monkey kidney cells following intracellular persistence, suggesting these viruses can evade amoebal digestion and structural degradation. In the case of HAdV, nuclear incorporation, preservation of capsid integrity, and detection of mRNA associated with adenoviral fiber protein synthesis further suggest the possible initiation of virus-related transcriptional activity within the amoeba host. These findings challenge current assumptions about virus removal rates in sewage treatment, food safety protocols, and drinking water production. The enhanced persistence and protection conferred by FLA may also impact microbial risk assessments for recreational water use, particularly in sewage-impacted rivers and lakes. Recognition of FLA as reservoirs and transport vessels for enteric viruses necessitates a re-evaluation of existing water and sanitation guidelines to better mitigate environmental transmission pathways. Graphical Abstract

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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