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Enregistrement W4409292250 · doi:10.1080/10408444.2025.2464067

The use of canonical dose–response models for benchmark dose analysis of continuous toxicological data

2025· review· en· W4409292250 sur OpenAlexafffund
Wout Slob, Martine Bakker, Bas Bokkers, Guangchao Chen, Weihsueh A. Chiu, Wim Mennes, Mioara Alina Nicolaie, R. Woodrow Setzer, Paul A. White

Notice bibliographique

RevueCritical Reviews in Toxicology · 2025
Typereview
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueToxic Organic Pollutants Impact
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesRijksinstituut voor Volksgezondheid en MilieuNational Institute of Environmental Health SciencesHealth CanadaNational Institutes of HealthNational Center for Advancing Translational SciencesMinisterie van Landbouw, Natuur en Voedselkwaliteit
Mots-clésMedicineToxicologyEconometricsPharmacologyMathematicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The benchmark dose (BMD) approach employs dose-response modeling to determine the dose associated with a small change in response relative to the background response. Here, we introduce a conceptual framework for modeling continuous data that is based on key risk assessment principles and requirements. Based on this framework, we define a class of dose-response models sharing the same four biologically interpretable model parameters, while exhibiting five common properties that are essential from a risk assessment perspective: such models are denoted as "canonical" models. The first two canonical properties are straightforward: property 1. The models should predict positive values only (as measurements of continuous endpoints are typically positive) and property 2. the outcomes should not depend on the measurement unit. Canonical property 3 reflects the observation that toxicological dose-response data related to different subgroups (e.g. species, sexes, and exposure durations) are typically (at least approximately) parallel on a log-dose scale, which is at the same time an implicit assumption in defining fundamental toxicological concepts, such as extrapolation factors, relative potency factors (RPFs), and relative sensitivity factors (RSFs). Property 4 is needed to enable comparisons of the sensitivity of endpoints differing in maximum response. A fifth canonical property reflects our view that choices regarding the dose-response model expression, the assumed distribution for the within-group variation, and the benchmark response (BMR) that is being used should be internally consistent. The canonical models that we discuss are suitable to fit parallel dose-response curves to combined datasets related to different subgroups (e.g. species, sexes, and exposure durations). Doing so provides a tool to check canonical property 3 of the particular data analyzed. We provide a review of empirical evidence indicating that this property has general validity, which is highly fortunate, as this legitimizes the use of extrapolation factors and RPFs in risk assessment. We then evaluate to what extent the approaches in current BMD guidance by European Food Safety Authority (EFSA) or U.S. Environmental Protection Agency (US-EPA) comply with the principles of canonical dose-response modeling, concluding that this is only partly the case. The latter can have unfavorable and sometimes far-reaching consequences. For instance, some of the recommended non-canonical models result in different BMDs when changing the measurement unit (e.g. µg to mg). As another example, the BMD tool recently developed by EFSA implements covariate analysis in such a way that canonical property 3 cannot possibly be represented by any of the models. As another disadvantage, non-canonical models preclude the effective development and use of prior distributions in a Bayesian approach. Finally, we argue that a concomitant but important advantage of only using canonical models is that BMD methodology will be more transparent, so that risk assessors will be better able to understand it, and BMDs with high societal impact can be more easily defended. The present paper may be a helpful tool for toxicologists and risk assessors to critically follow the developments in BMD methodology at the conceptual level.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,034
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,100

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,034
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,004
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0020,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,226
Tête enseignante GPT0,439
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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