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Enregistrement W4409293606 · doi:10.1101/2025.04.03.647075

Hypoxic-Core (HyCo) Spheroids Recapitulate Hallmarks of Clinical Hypoxia: A Simple Chip-Based Method for Translational Oncology

2025· preprint· en· W4409293606 sur OpenAlexafffund
Elena Refet-Mollof, Rodin Chermat, Julie Lafontaine, Run Zhou Ye, Thomas Gervais, Philip Wong

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversité de MontréalPolytechnique Montréal
Organismes subventionnairesInstitute of Cancer ResearchFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaInstitut Du Cancer de MontréalCanada First Research Excellence Fund
Mots-clésSpheroidHypoxia (environmental)Simple (philosophy)Cancer researchPrecision oncologyComputer scienceOncologyMedicineComputational biologyInternal medicineChemistryBiologyCancerGeneticsCell culturePhilosophy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Hypoxia influences the biology and response of cancers. No user-friendly device allows the study of hypoxia on highly-controlled clinically-relevant tumor models. Here, we describe how hypoxic-core (HyCo) spheroids generated using our unique non-perfused microfluidic device recapitulate key clinical hallmarks of hypoxia in vitro . Our PDMS-made system can generate up to 240 spheroids naturally exhibiting a diffusion-driven hypoxic core in only 4 days, here from two sarcoma cell lines. Compared to smaller normoxic spheroids from the same cell lines, known hypoxia-related genes are upregulated in HyCo spheroids. In addition, HyCo spheroids display hallmark hypoxia-induced resistance to radiotherapy and chemotherapy, along with increased invasiveness. Finally, to demonstrate applications of our HyCo spheroids and on-chip framework in drug development, we used our HyCo-derived gene expression dataset to select a drug candidate (diethyl-pythiDC) and confirmed its effect on spheroid invasiveness. Our results suggest that HyCo spheroids can be efficiently used as translational tools to integrate hypoxia in cancer research, without complex workflows or setups. Teaser On-chip spheroids with a natural hypoxic-core emulate clinical cancer hypoxia hallmarks essential for novel therapy development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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