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Enregistrement W4409321658 · doi:10.1101/2025.04.08.647778

Age-dependent expression and antiviral activity of interferon epsilon in respiratory epithelium

2025· preprint· en· W4409321658 sur OpenAlexfundno aff
Mary McCabe, Helen Groves, Erin M P E Getty, Emma Campbell, Connor Bamford, Guillermo López–Campos, Michael D. Shields, Ultan F. Power

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiquePediatric health and respiratory diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHealth and Social Care Northern IrelandDepartment for the EconomyHospital for Sick ChildrenWellcome TrustPublic Health AgencySanofiAstraZeneca
Mots-clésInterferonRespiratory epitheliumEpitheliumRespiratory systemExpression (computer science)VirologyBiologyMedicineImmunologyInternal medicinePathologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Respiratory syncytial virus (RSV) disease burden is greatest between 6 weeks and 6 months of life, with young age the most common risk factor among hospitalized children. A robust innate immune response in the airway epithelium is crucial for mitigating RSV-associated disease, but early-life immune responses to infection remain largely unexplored. RNA-seq analysis of RSV-infected primary nasal epithelial cell cultures from healthy infants at birth and 1 year revealed diminished expression of interferon epsilon ( IFNE ), a poorly characterized type I IFN, in newborns vs 1 year. We hypothesized, therefore, that IFNE plays an important role during infant RSV infection. We found that IFNE is basally expressed in airway epithelial cell lines. Recombinant human IFNε (rhIFNε) induced an antiviral state against an RSV clinical isolate and related Sendai virus, but not SARS-CoV-2 under the conditions tested. The antiviral potency of rhIFNε was diminished relative to rhIFN beta (rhIFNβ1) or rhIFN lambda-1 (rhIFNλ1), as evidenced by IC 50 data. Importantly, rhIFNε induced similar ISGs as rhIFNβ1 but demonstrated a transient temporal expression profile that differed from both rhIFNβ1 and rhIFNλ1. These results suggest that lower IFNε expression at birth may contribute to increased susceptibility to severe RSV-associated disease, offering insights into potential interventions. IMPORTANCE Respiratory syncytial virus (RSV) is a major pediatric respiratory pathogen. Despite advances in vaccine development and monoclonal antibody prophylaxis, the immune factors driving RSV-associated disease remain unclear. Notably, severe disease is not limited to recognized high-risk groups; most affected children share only young age as a risk factor. To better understand virus-host interactions in early life, we previously derived primary airway epithelial cell cultures from the same healthy newborns at birth and at 1 year, infected them with a clinical RSV isolate, and performed total RNA sequencing. In this study, we present evidence that the transcriptional expression of interferon epsilon ( IFNE ), a relatively understudied type I interferon, varies with chronological age, coinciding with the period of the greatest burden of severe RSV-associated disease. We also show that recombinant human IFNε exhibits antiviral activity against RSV in airway epithelial cells, although with reduced potency compared to other type I and III interferons. These results expand our understanding of interferon responses during early-life RSV infection and suggest that reduced IFNε expression in newborns may partly explain their increased vulnerability to severe disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
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