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Enregistrement W4409333581 · doi:10.3390/ijms26083571

Identification and Characterization of WOX Gene Family in Flax (Linum usitatissimum L.) and Its Role Under Abiotic Stress

2025· article· en· W4409333581 sur OpenAlexaff
Xixia Song, Jianyu Lu, Hang Wang, Lili Tang, Shuyao Li, Zhenyuan Zang, Guangwen Wu, Jian Zhang

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLinumAbiotic componentIdentification (biology)Abiotic stressBiologyGeneBotanyGeneticsEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The WOX (WUSCHEL-related homeobox) gene family plays pivotal roles in plant growth, development, and responses to biotic/abiotic stresses. Flax (Linum usitatissimum L.), a globally important oilseed and fiber crop, lacks a comprehensive characterization of its WOX family. Here, 18 LuWOX genes were systematically identified in the flax genome through bioinformatics analyses. Phylogenetic classification grouped these genes into three clades: Ancient, Intermediate, and WUS Clades, with members within the same clade exhibiting conserved exon–intron structures and motif compositions. Promoter analysis revealed abundant cis-acting elements associated with hormone responses (MeJA, abscisic acid) and abiotic stress adaptation (anaerobic induction, drought, low temperature). Segmental duplication events (nine gene pairs) contributed significantly to LuWOX family expansion. Protein–protein interaction networks implicated several LuWOX proteins in stress-responsive pathways. Expression profiling demonstrated that most LuWOX genes were highly expressed in 5-day-post-anthesis (DPA) flowers and embryonic tissues. qRT-PCR validation further uncovered distinct expression patterns of LuWOX genes under cold, drought, and salt stresses. This study established a foundational framework for leveraging LuWOX genes to enhance stress tolerance in flax breeding and functional genomics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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