An updated phylogeny of Boraginales based on the Angiosperms353 probe set: a roadmap for understanding morphological evolution
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND AIMS: Boraginales, a subcosmopolitan order with ~2700 species in currently 11 families, has seen fluctuating classification at the family and generic levels. Gynoecium and fruit morphology have been pivotal in morphological classifications, but a systematic evaluation based on anatomical and ontogenetic data has not been attempted. METHODS: We revisited the phylogenetic relationships in Boraginales by analysing 162 newly sequenced samples using the Angiosperms353 probe set, together with existing data from 88 samples. Our sampling covers >80 % of the genera and all currently and previously recognized families. A morphological assessment of taxonomically important gynoecial and fruit characters was done to guide our proposed family-level classification. KEY RESULTS: The phylogenies are largely consistent with previous phylogenetic studies, with better resolution overall and support from both datasets (exons, supercontigs) and all analyses implemented (coalescence, ASTRAL-Pro3, concatenation). The placement of Hydrophyllaceae as nested within Namaceae is a novel result, while the placement of the parasitic Lennoaceae as nested within Ehretiaceae is confirmed with maximum confidence. The placement of Codonaceae remains ambiguous: retrieved within Boraginales I, as sister to the clade comprising Wellstediaceae and Boraginaceae based on exons, and as sister branch to all remaining Boraginales II based on supercontigs. We propose the recognition of a total of nine families in Boraginales. Tribal relationships in Boraginaceae subfam. Cynoglossoideae are fully resolved for the first time. Our data show that shifts in placentation and ovule number are instrumental for the arisal of complex internal ovary architectures. CONCLUSIONS: The results highlight the effectiveness of the Angiosperms353 probe set for understanding the evolutionary history of Boraginales and pave the way for resolving remaining unresolved nodes and taxonomic issues. Complex modifications of bicarpellate ovaries led to an extreme and lineage-specific diversification of fruits that probably played a crucial role in Boraginales macroevolution. Combining this highly resolved phylogeny with future critical morphological analyses promises a deep understanding of evolutionary trajectories in Boraginales.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».