Identification and expression analysis of AP2/ERF transcription factors (DREB and ERFs) involved in cold stress response in <i>Asparagus officinalis</i>
Notice bibliographique
Résumé
APETALA2/ethylene response factor (AP2/ERF) transcription factors have been identified in many plant species, and their subfamilies play crucial roles in the regulation of gene expression in response to cold stress. Molecular pathways of cold stress response, however, have not been studied in asparagus. Using two contrasting cultivars, the objective of this study was to evaluate C-repeat binding factor (CBF) gene expression in response to cold shock and cold acclimation treatments in 10-week-old asparagus seedlings grown under controlled environment conditions. Two dehydration-responsive element binding (DREB) genes ( DREB2C and DREB2B), identified as potential CBF candidates, were induced at high levels, especially in the ferns and rhizomes of both cultivars. Cold acclimation led to stronger and longer-lasting DREB expression compared to cold shock treatment. Three ERF genes were downregulated in both cultivars for the two treatments, suggesting negative regulation of cold stress response. Using the genes under study, no gene expression differences were observed between the two cultivars for either of the treatments. Further experimental validation is needed to determine whether DREB2C and DREB2B genes fully function as CBFs and if they share roles with stress-responsive DREB genes. Understanding cold response mechanisms in asparagus may facilitate strategies to enhance freezing tolerance of the crop.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».