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Enregistrement W4409361582 · doi:10.3390/d17040269

New Insight into the Demography History, Evolution, and Phylogeography of Horseshoe Crabs with Special Emphasis on American Species

2025· article· en· W4409361582 sur OpenAlexaff
José Manuel García‐Enriquez, Salima Machkour‐M’Rabet, Yann Hénaut, Sophie Calmé, Julia María Lesher-Gordillo

Notice bibliographique

RevueDiversity · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueSubterranean biodiversity and taxonomy
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesUniversidad Juárez Autónoma de TabascoSecretaría de Ciencia, Tecnología e Innovación del Distrito FederalRufford Foundation
Mots-clésPhylogeographyBiologyHorseshoe crabGeographyEcologyZoologyFisheryPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Xiphosurids (Merostomata, Xiphosura) are a group of chelicerates with a rich and complex evolutionary history that is constantly being updated through new discoveries. In this study, we re-estimated the divergence time of the extant horseshoe crab species with new fossil calibration points and addressed the inter- and intraspecific relationships of the American horseshoe crab through a phylogeographic perspective. In order to achieve our objectives, three datasets were compiled from fragments of different lengths of the COI gene that include sequences from 154 individuals, representing the Mexican populations. In addition to these, the datasets also included previously published sequences corresponding to individuals from different US populations and Asian horseshoe crab species. Firstly, we estimated the divergence times of extant horseshoe crab species by Bayesian methods using multiple fossil calibration points. Subsequently, we investigated the phylogeographic relationships and demographic history of Limulus polyphemus in the Americas utilizing various datasets. The time of divergence of the two Asian species clades was estimated to be approximately 127 million years ago (Ma). Phylogeographic relationships between the Asian and American species are linked through a minimum of 86 mutational steps. In America, phylogeographic relationships reflect differentiation between US and Mexican populations of L. polyphemus. We detect signs of demographic expansion for the Mexican population during the last 75,000 years, as well as an absence of phylogeographic structuring. The evolutionary history of horseshoe crabs is older than previously believed; however, the current distribution and demographic changes have probably been influenced by environmental events of the recent past, such as the glacial–interglacial periods that occurred during the Pleistocene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,123
Score d'incertitude au seuil0,989

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,162
Écart entre enseignants0,147 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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