Minimal Introgression but Restricted Gene Flow: How Stocking and Dams Influence Wild Brook Trout (<scp><i>Salvelinus fontinalis</i></scp>) Genetics and Morphology
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Anthropogenic activities are increasingly influencing eco‐evolutionary processes across spatial, temporal, and biological scales. Freshwater ecosystems, harbouring species that are important for subsistence, recreational, and commercial fisheries, are particularly vulnerable. In North America, brook trout (Salvelinus fontinalis) populations have experienced widespread declines due to factors including habitat fragmentation and angling. To increase population densities and meet fishing demands, thousands of captive‐bred individuals are released annually. Stocking, however, could lead to introgression of maladaptive genes into the wild population and, in combination with the presence of dams restricting gene flow, may reduce their evolutionary potential. Here, we sampled 495 fish from 14 inland and two coastal sites in the state of Rhode Island, USA and from two hatchery strains. We used quaddRAD to develop single nucleotide polymorphism (SNP) markers and combined genetic and geometric‐morphometric analyses to evaluate intraspecific variation, the consequences of stocking, and test hypotheses, in a riverscape framework, on how dams influence gene flow. We found moderate genetic structure within streams with low levels of genetic diversity and effective population sizes but higher than the two hatchery strains. Importantly, we found no significant introgression from captive‐bred individuals. However, we did detect isolation‐by‐distance and ‐by‐resistance (due to dams) with evidence for upstream and downstream gene flow occurring mainly within catchments. Phenotypic differentiation also was apparent both between wild and hatchery brook trout and even among streams, correlating with genetic distances. Our findings highlight the importance of fine‐scale analyses in evaluating anthropogenic impacts and uncovering hidden intraspecific variation. Conservation efforts for wild brook trout populations, which harbour distinct genetic and phenotypic variation, will require careful attention, and our results will help inform management strategies across the species' range.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».