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Enregistrement W4409377880 · doi:10.1101/2025.04.11.648453

Overlooked signals: Highly stable quorum sensing molecule in phage lysates induces quorum sensing response

2025· preprint· en· W4409377880 sur OpenAlexfundno aff
Amalie Høgh Eichler, Jesper Juel Mauritzen, Kira Koonce, Gagandeep Kaur, Nina Molin Høyland‐Kroghsbo

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversité Laval
Mots-clésQuorum sensingChemistryBiologyBacteriaBiofilmGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phage-bacterial interaction studies routinely apply phage lysates at final concentrations of up to 10% of the culture. Consequently, bacterial metabolites such as quorum sensing (QS) signaling molecules are transferred along with the phage lysate to recipient bacterial cells. Here, we show that the Pseudomonas aeruginosa QS molecules 3OC12-HSL and C4-HSL are rapidly degraded in phage lysates. In contrast, the hydrophobic QS molecule PQS is remarkably stable, for at least one year, due to its binding within outer membrane vesicles. Strikingly, we find that PQS exceeds concentrations of 10 µM in standard phage lysate preparations. We show that PQS carried over from phage lysates induces QS-controlled production of the virulence factor pyocyanin in P. aeruginosa . This PQS carryover does not oppose previous conclusions of phage infection-induced PQS production, as we show here, that this response is also triggered by PQS-free phage lysates. Since other bacterial species, including Paracoccus and Vibrio harveyi , also produce hydrophobic QS molecules that are bound within outer membrane vesicles, it is likely that phage lysates from these bacteria may similarly contain stable QS molecules. Collectively, we demonstrate that membrane-bound QS molecules may significantly confound QS-related physiological outcomes of phage-host interaction studies. This can be avoided by using QS synthase mutants for phage propagation or by purifying phage particles from lysates to eliminate QS molecule carryover.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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