MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4409397002 · doi:10.1111/jse.13175

Phylogeny, biogeography, reticulation, and classification of <i>Agrostis</i> (Poaceae: Pooideae: Poeae: Agrostidinae) with expansion of <i>Polypogon</i> to include <i>Lachnagrostis</i> (in part)

2025· article· en· W4409397002 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Systematics and Evolution · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Taxonomy and Phylogenetics
Établissements canadiensCanadian Museum of Nature
Organismes subventionnairesComunidad de MadridU.S. Department of AgricultureNational Geographic SocietySmithsonian Institution
Mots-clésAgrostisBiologyCladeBotanyGenusPoaceaePhylogeneticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract To investigate the evolutionary relationships and biogeographical history among the species of Agrostis and allied genera within the subtribe Agrostidinae, we generated a phylogeny based on sequences from nuclear ribosomal DNA (ITS) and three plastid regions ( rpl32‐trnL spacer, rps16‐trnK spacer, and rps16 intron). We also aimed to assess the generic limits of Agrostis , characterize possible subgeneric relationships among species in the genus, identify hypothesized reticulation events, and present our biogeographical theory. Based on our phylogeny of 198 samples, representing 138 species (82 from Agrostis as currently recognized, 10 from Polypogon , and 10 from Lachnagrostis ), we identify two strongly supported clades within Agrostis : clade Longipaleata ( Agrostis subg. Vilfa ) and clade Brevipaleata ( A . subg. Agrostis ). The species of Agrostis in clade Longipaleata usually have florets with paleas 2/5 to as long as the lemma, whereas species in clade Brevipaleata have florets with paleas less than 2/5 as long as the lemma, minute, or absent. Core (species with congruent alignment using ITS and plastid data) phylogenetic analysis of Agrostis reveals three strongly supported clades within Longipaleata (European‐Northwest African, Asian, and African), three strongly supported clades within Brevipaleata (Asian, North American, and South American), and a European grade leading to the latter two. Of the six genera commonly associated with Agrostis , that is, Bromidium , Polypogon, Lachnagrostis, Linkagrostis, Chaetopogon, and Chaetotropis , only Polypogon maintained its status as a separate genus, while the remaining genera are subsumed within Agrostis or Polypogon . Polypogon is identified as an intergeneric hybrid originating via ancient hybridization between unknown representatives of Agrostis clade Longipaleata (plastid DNA) and Calamagrostis clade Americana (nrDNA). We include several species of Lachnagrostis , including the type ( L. filiformis ), that follow the same pattern in Polypogon , while the remaining species of Lachnagrostis in our study are identified as ancient intersubgeneric hybrids within Agrostis . We propose nine new combinations in Polypogon : P. adamsonii (Vickery) P.M. Peterson, Soreng &amp; Romasch.; P. aemulus (R. Br.) P.M. Peterson, Soreng &amp; Romasch.; P. billardierei (R. Br.) P.M. Peterson, Soreng &amp; Romasch.; P. bourgaei (E. Fourn.) P.M. Peterson, Soreng &amp; Romasch.; P. filiformis (G. Forst.) P.M. Peterson, Soreng &amp; Romasch.; P. littoralis P.M. Peterson, Soreng &amp; Romasch.; P. exaratus (Trin.) P.M. Peterson, Soreng &amp; Romasch.; P. polypogonoides (Stapf) P.M. Peterson, Soreng &amp; Romasch.; and P. reuteri (Boiss.) P.M. Peterson, Soreng &amp; Romasch. We designate lectotypes for the names Agrostis sect. Aristatae Willd., Agrostis barbuligera Stapf, A. bourgaei E. Fourn., A. eriantha Hack., A. exarata Trin., A. lachnantha Nees, A. polypogonoides Stapf, Chaetotropis chilensis Kunth, Polypogon elongatus Kunth, P. inaequalis Trin., P. suspicatus Willd., and Vilfa muricata J. Presl .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,569
Score d'incertitude au seuil0,258

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle