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Enregistrement W4409403709 · doi:10.1093/mtomcs/mfag019

The PBAF chromatin remodeling complex contributes to metal homeostasis through MTF1 regulation

2025· preprint· en· W4409403709 sur OpenAlex
Emma Eileen Johnston, David C. Klein, Odette Verdejo‐Torres, Antonio Rivera, Michael Quinteros, Aidan T. Pezacki, Christopher J. Chang, Sarah J. Hainer, Teresita Padilla‐Benavides

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueMetallomics · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMelanoma and MAPK Pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesCenter for Research Computing, University of PittsburghNational Institutes of HealthUniversity of PittsburghCanadian Institute for Advanced Research
Mots-clésChromatin remodelingChromatinCell biologyHomeostasisBiologyGeneticsDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT SWI/SNF chromatin remodeling complexes regulate gene expression by modulating nucleosome positioning, yet their roles in metal homeostasis during skeletal muscle development remain unclear. Here, we uncover distinct functions of the BAF, PBAF, and ncBAF complexes in myoblast proliferation under metal stress. While knockdown (KD) of Baf250a (BAF-specific) or Brd9 (ncBAF-specific) reduces myoblast proliferation, Baf180 (PBAF-specific) KD does not impair cell proliferation under basal conditions. Interestingly, supplementation with copper (Cu) or zinc (Zn) rescues proliferation in Baf250a - and Brd9 -deficient myoblasts but paradoxically inhibits growth in Baf180 KD cells. Mechanistically, Baf180 KD disrupts Cu and Zn homeostasis, leading to intracellular Cu accumulation without labile Cu⁺ pools and impaired expression of Atp7a , a key Cu exporter. Transcriptomic analyses reveal widespread gene dysregulation in metal-treated Baf180 -deficient cells, while metal supplementation promotes pro-proliferative gene expression in Baf250a - and Brd9 -KD myoblasts. CUT&RUN assays demonstrate that metal-responsive transcription factor Mtf1 exhibits increased chromatin binding upon Cu treatment, targeting genes involved in stress response and myogenesis. Notably, Mtf1 colocalizes with Baf180 in the nucleus and co-immunoprecipitates with both conserved SWI/SNF subunits and Baf180, suggesting a functional interplay between PBAF and Mtf1 in regulating metal-dependent gene expression. Our findings establish the PBAF complex as a crucial regulator of Cu/Zn homeostasis in myoblast proliferation via Mtf1, while metal supplementation compensates for BAF and ncBAF dysfunction but exacerbates defects in PBAF-deficient cells. This study reveals a novel link between chromatin remodeling, metal signaling, and muscle development, with implications for stress adaptation and metabolic regulation in myogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,668
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle