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Enregistrement W4409411608 · doi:10.1128/msphere.00098-25

Characterizing antimicrobial activity of environmental <i>Streptomyces</i> spp. and oral bacterial and fungal isolates from <i>Canis familiaris</i> and <i>Felis catus</i>

2025· article· en· W4409411608 sur OpenAlexafffund
A. E. Cowen, Bonnie Yiu, Sara Fallah, Kirsten J. Meyer, Emily Puumala, Yunjin Lee, Haley L. Zubyk, Nicole Robbins, Justin R. Nodwell, Jessie MacAlpine, Leah E. Cowen

Notice bibliographique

RevuemSphere · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNHLBI Division of Intramural ResearchDivision of Intramural Research, National Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthCanadian Institute for Advanced Research
Mots-clésAntimicrobialMicrobiologyBiologyCandida albicans

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Antimicrobials are a pillar of modern medicine, yet our limited arsenal of antibiotics and antifungals is currently threatened by widespread drug resistance. Ongoing efforts are focused on developing strategies to identify compounds that enhance the efficacy of current antimicrobials and develop novel, resistance-evasive therapeutic strategies. In this study, we characterized microbial isolates from two distinct environments to identify those that exhibit antimicrobial activity alone and in combination with current antimicrobials: (i) oral isolates from domesticated animals and (ii) environmental Streptomyces spp. First, conditioned media prepared from bacterial and fungal oral isolates that were collected from Canis familiaris and Felis catus were screened for antibacterial and antifungal activity. Three supernatants from bacterial isolates exhibited antifungal activity against the human fungal pathogen Candida albicans in the presence of subinhibitory concentrations of fluconazole, the most widely deployed antifungal. Additionally, two bacterial isolates displayed antibacterial activity against Escherichia coli alone and in combination with the antibacterial ampicillin. Furthermore, 32 environmental isolates of confirmed and predicted Streptomyces spp. were screened for activity against C. albicans and E. coli . Cell-free media harvested from isolates WAC5038 and WAC5287 exhibited antifungal activity against Candida spp., while only the WAC5038-conditioned medium displayed antibacterial activity. Bioactivity-guided fractionation, coupled with UV/Vis absorbance spectra, suggested that the bioactive compound in WAC5287 has a similar absorbance spectrum to the antifungal class of polyenes, while the bioactive component of WAC5038 remains unknown. Overall, this work highlights a strategy to collect and screen environmental isolates for the identification of novel antimicrobials. IMPORTANCE The emergence and spread of antimicrobial resistance presents a global health challenge. As such, researchers are focused on developing pipelines to discover novel antimicrobials. In this study, we screened two distinct collections of microbes for antimicrobial activity. First, we collected bacterial and fungal isolates from the oral cavities of domesticated dogs and cats and identified these isolates using 16S (bacteria) and ITS (fungi) sequencing. Follow-up analyses confirmed that some conditioned media from bacterial isolates had antibacterial activity against Escherichia coli and antifungal activity against Candida albicans both alone and in combination with the current antimicrobial drugs. Additionally, screening 32 predicted or confirmed Streptomyces environmental isolates for antifungal and antibacterial activity identified two isolates with antifungal activity (WAC5038 and WAC5287), with only one isolate demonstrating antibacterial activity (WAC5038). Overall, this study provides a framework to identify and characterize environmental microbes with antimicrobial activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,086
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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