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Enregistrement W4409427820 · doi:10.1038/s41597-025-04970-5

Establishing a comprehensive host-parasite stable isotope database to unravel trophic relationships

2025· article· en· W4409427820 sur OpenAlexaff
Amandine Sabadel, Philip M. Riekenberg, Mónica Ayala-Díaz, Mark C. Belk, Jerusha Bennett, Antonio Bode, Sarah J. Bury, Laurent Dabouineau, Josette Delgado, Brittany Finucci, R. García-Seoane, Luisa Giari, Jessica Henkens, Lonneke L. IJsseldijk, Tijs Joling, Ollie Kerr-Hislop, Colin D. MacLeod, Lauren Meyer, Rona A. R. McGill, Eleonora Negro, Petra Quillfeldt, Cecile Reed, C. H. Roberts, Bahram Sayyaf Dezfuli, Olaf Schmidt, Anthony Sturbois, Andrew D. Suchomel, David W. Thieltges, Carl D. van der Lingen, Marcel T. J. van der Meer, Inés G. Viana, Mark Weston, Trevor J. Willis, Antoine Filion

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueIsotope Analysis in Ecology
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAgencia Estatal de InvestigaciónMarsden FundHORIZON EUROPE Framework ProgrammeMinistry of Business, Innovation and EmploymentRoyal Society Te ApārangiEuropean Commission
Mots-clésHost (biology)Trophic levelStable isotope ratioParasite hostingDatabaseBiologyEcologyComputer scienceWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Over the past decades, stable isotopes have been infrequently used to characterise host-parasite trophic relationships. This is because we have not yet identified consistent patterns in stable isotope values between parasites and their host tissues across species, which are crucial for understanding host-parasite dynamics. To address this, we initiated a worldwide collaboration to establish a unique database of stable isotope values of novel host-parasite pairs, effectively doubling the existing data in published literature. This database includes nitrogen, carbon, and sulphur stable isotope values. We present 3213 stable isotope data entries, representing 586 previously unpublished host-parasite pairs. Additionally, while existing literature was particularly limited in sulphur isotope values, we tripled information on this crucial element. By publishing unreported host-parasite pairs from previously unsampled areas of the world and using appropriate host tissues, our dataset stands unparalleled. We anticipate that end-users will utilise our database to uncover generalisable patterns, deepening our understanding of the complexities of parasite-host relationships and driving future research efforts in stable isotope parasitology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0030,005
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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