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Enregistrement W4409450984 · doi:10.1038/s41746-025-01504-6

Network analysis of extraintestinal manifestations and associated autoimmune disorders in Crohn’s disease and ulcerative colitis

2025· article· en· W4409450984 sur OpenAlexafffund
Daniel C. Baumgart, C.‐H. CHENG, Tian X. Du, Michael Parkes, Daniel Sadowski, Eytan Wine, Frank Hoentjen, Brendan P. Halloran, Aldo J. Montaño‐Loza, Sergio Zepeda-Gómez, Karen Wong, Farhad Peerani, Randolph Goebel, J. Ross Mitchell

Notice bibliographique

Revuenpj Digital Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensAlberta Health ServicesUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta InnovatesUniversity of AlbertaAlberta Machine Intelligence InstituteCanadian Institutes of Health ResearchMitacsCanadian Institute for Advanced Research
Mots-clésUlcerative colitisGastroenterologyInflammatory bowel diseaseMedicineInternal medicineCrohn's diseaseDiseaseColitisImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We detect and interactively visualize occurrence, frequency, sequence, and clustering of extraintestinal manifestations (EIM) and associated immune disorders (AID) in 30,334 inflammatory bowel disease (IBD) patients (Crohn's disease (CD) n = 15924, ulcerative colitis (UC) n = 11718, IBD unclassified, IBD-U n = 2692, 52% female, median age 40 years (IQR: 25)) with artificial intelligence (AI). 57% (CD > UC 60% vs. 54%, p < 0.00001) had one or more EIM and/or AID. Mental, musculoskeletal and genitourinary disorders were most frequently associated with IBD: 18% (CD vs. UC 19% vs. 16%, p < 0.00001), 17% (CD vs. UC 20% vs. 15%, p < 0.00001) and 11% (CD vs. UC 13% vs. 9%, p < 0.00001), respectively. AI detected 4 vs. 5 vs. 5 distinct EIM/AID communities with 420 vs. 396 vs. 467 nodes and 11,492 vs. 9116 vs. 16,807 edges (links) in CD vs. UC vs. IBD, respectively. Our newly developed interactive free web app shows previously unknown communities, relationships, and temporal patterns-the diseasome and interactome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,409

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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