Protocol for mpox virus inactivation in containment level 3 for safe handling of animal samples
Notice bibliographique
Résumé
High biocontainment is required to handle infectious mpox virus (MPXV) specimens, which can hinder research and diagnostic efforts during outbreaks. Here, we present a protocol for inactivating MPXV-contaminated animal samples using commercial lysis buffers. We describe steps for virus propagation and quantification and MPXV inactivation. We then detail procedures for validating the inactivation using a cell-based technique and qPCR. This protocol provides a framework for safely managing MPXV in lower-containment laboratories, facilitating downstream applications and improved outbreak management. • Guidelines for collecting animal samples from CL2 agriculture and spiking with MPXV • Steps to test DNA/RNA extraction kits for their effectiveness in inactivating MPXV • Guidance for inactivation that preserves nucleic acids for downstream applications • Procedure to confirm virus inactivation using cell infection assays and qPCR Publisher’s note: Undertaking any experimental protocol requires adherence to local institutional guidelines for laboratory safety and ethics. High biocontainment is required to handle infectious mpox virus (MPXV) specimens, which can hinder research and diagnostic efforts during outbreaks. Here, we present a protocol for inactivating MPXV-contaminated animal samples using commercial lysis buffers. We describe steps for virus propagation and quantification and MPXV inactivation. We then detail procedures for validating the inactivation using a cell-based technique and qPCR. This protocol provides a framework for safely managing MPXV in lower-containment laboratories, facilitating downstream applications and improved outbreak management.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».