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Enregistrement W4409497140 · doi:10.1093/lambio/ovaf059

Thermophilic <i>Pseudomonas aeruginosa</i> strain Ch39 isolated from Chignahuapan hot springs in Puebla, Mexico

2025· article· en· W4409497140 sur OpenAlexaff
Hugo G. Castelán‐Sánchez, Jennifer V Fernández Dodero, Jorge Rojas-Vargas, Fernando Martínez-Ocampo, Juan Manuel Hurtado-Ramírez, David Israel Ríos-Vázquez, Patricia Sánchez Alonso, Candelario Vázquez‐Cruz, Norma Elena Rojas-Ruíz

Notice bibliographique

RevueLetters in Applied Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesBenemérita Universidad Autónoma de PueblaUniversidad Nacional Autónoma de México
Mots-clésPseudomonas aeruginosaTetracyclineThermophileBiologyMicrobiologyBacteriaGeneAntibiotic resistanceStrain (injury)Heat shock proteinAntibioticsAntimicrobialMinimum inhibitory concentrationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thermophilic bacteria have specific metabolic specializations to survive at high temperatures. This study focuses on Pseudomonas aeruginosa strain Ch39, a new isolate from mineral-rich thermal water from Chignahuapan, Puebla, Mexico. Biochemical testing, whole genome sequencing, and antimicrobial resistance profiling of strain Ch39 yielded significant detailed results. Genome sequencing yielded a high-quality 6.68 Mb assembly with a GC content of 66.13%, and annotation identified 4 356 protein-coding genes, including heat shock and antibiotic resistance genes. Comparative analysis of growth kinetics with the reference strains ATCC 27853 and PAO1 showed that Ch39 exhibited good growth and thermotolerance, with viability at 45°C, due to putative genetic adaptations such as heat shock proteins. Antibiotic resistance profiling showed variability in resistance profiles and the presence of resistance genes. In particular, strain Ch39 showed increased minimum inhibitory concentrations for some of the antibiotics tested, such as tetracycline (>1000 µg/mL), compared to the control strains. The observations made here emphasize the thermoadaptation of the strain and its suitability as a reservoir for antibiotic-resistance genes. This study expands our understanding of the thermophilic adaptation of P. aeruginosa and its ecological and clinical significance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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