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Enregistrement W4409528196 · doi:10.1071/en24054

Aqueous lead speciation determined using DNAzyme GR5

2025· article· en· W4409528196 sur OpenAlexfundno aff
Gaganprit Gill, Juewen Liu, Heather M. Gaebler, Ian Hamilton, D. Scott Smith

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Chemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGlobal Water FuturesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDeoxyribozymeGenetic algorithmChemistryAqueous solutionEnvironmental chemistryLead (geology)ChromatographyBiologyDetection limitEvolutionary biologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Environmental context The on-site and real-time detection of metal ions is important for environmental monitoring and risk assessment. For appropriate management decisions, it is necessary to specifically sense the labile fraction of metal rather than total metal. This study provides a proof-of-principle that the DNAzyme GR5 can be used to sense labile lead in natural waters containing dissolved organic matter. Rationale DNAzyme-based sensors are a promising technology for possible labile metal monitoring that have not yet been fully tested in real waters. In clean, buffered, laboratory waters specific DNAzymes interact with specific metal ions and produce a signal (e.g. fluorescence). In more complex natural solutions the free ion concentration is reduced by complexation (e.g. to dissolved organic matter, DOM) and the signal would not be proportional to total metal, but hypothetically proportional to the labile fraction of total metal; i.e. the fraction of metal available to interact with the DNA. Methodology Here, an existing metal specific RNA-cleaving DNAzyme for Pb2+ (GR5) is used to test waters representative of natural solutions. Samples were prepared with ionic strengths from 25 to 100 mM using sodium acetate, sodium chloride and sodium bicarbonate. In addition, pH values of 6.5, 7.5 and 8.5 were tested for the different electrolytes, with and without added dissolved organic carbon, at 2, 5 and 8 mg C L–1. Lead additions were performed at toxicologically relevant levels (less than or equal to 1 µM of added lead). Results and discussion The GR5 response was found to be dependent on ionic strength, including identity of the background electrolyte, where high ionic strength slowed the reaction and chloride media increased reaction speed. Reproducible responses of GR5 are possible at conditions similar to natural waters, except responses were too fast for high pH (8.5 or higher), low DOC (less than 2 mg C L–1) and low ionic strength (25 mM). It is found that GR5 responds to three lead species, PbOH+, PbCl+ and Pb2+, with relative sensitivities in the same order. GR5 does not respond to lead complexed with acetate, carbonate or DOM. It is possible to use the measured first-order rate constant for lead induced fluorescence of GR5 to calculate ionic lead that agrees within a factor of two with respect to Windermere Humic Aqueous Model predictions. Thus, GR5 may represent a labile lead probe, although further work is necessary to test this.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,649

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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