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Enregistrement W4409540564 · doi:10.1016/j.xcrm.2025.102085

Integrated liver-secreted and plasma proteomics identify a predictive model that stratifies MASH

2025· article· en· W4409540564 sur OpenAlex
William De Nardo, Olivia W. Lee, Yazmin Johari, Jacqueline Bayliss, M. Pensa, Paula M. Miotto, Stacey N. Keenan, Andrew Ryan, Tessa M Svinos, Geraldine Ooi, Wendy A. Brown, William Kemp, Stuart K. Roberts, Benjamin L. Parker, Magdalene K. Montgomery, Mark Larance, Paul R. Burton, Matthew J. Watt

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueCell Reports Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Disease Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMelbourne Research, University of MelbourneCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésKexinSteatohepatitisPCSK9Apolipoprotein BFatty liverProteomicsProteomeSecretionInternal medicineBiologyApolipoprotein A1EndocrinologyMedicineBioinformaticsDiseaseLipoproteinCholesterolBiochemistryGeneLDL receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Obesity is a major risk factor for metabolic-associated steatotic liver disease (MASLD), which can progress to metabolic-associated steatohepatitis (MASH). There are no validated non-invasive tests to stratify persons with obesity with a greater risk for MASH. Herein, we assess plasma and liver from 266 obese individuals spanning the MASLD spectrum. Ninety-six human livers were precision-cut, and mass spectrometry-based proteomics identifies 3,333 proteins in the liver-secretion medium, of which 107 are differentially secreted in MASH compared with no pathology. The plasma proteome is markedly remodeled in MASH but is not different between patients with steatosis and no pathology. The APASHA model, comprising plasma apolipoprotein F (APOF), proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 (PCSK9), afamin (AFM), S100 calcium-binding protein A6 (S100A6), HbA1c, and zinc-alpha-2-glycoprotein (AZGP1), stratifies MASH (area under receiver operating characteristic [AUROC] = 0.88). Our investigations detail the evolution of liver-secreted and plasma proteins with MASLD progression, providing a rich resource defining human liver-secreted proteins and creating a predictive model to stratify patients with obesity at risk of MASH. • Catalog of liver-secreted and plasma proteins with MASLD progression in humans • Mass spectrometry analysis identifies remodeling of plasma proteins in human MASH • Protein secretion from the liver is altered in human MASH • The APASHA model effectively stratifies patients with obesity at risk of MASH De Nardo et al. profile the plasma and liver-secreted proteome from obese individuals spanning the spectrum of MASLD. They identify biomarkers for MASH in persons with obesity and develop and validate a biologically plausible non-invasive risk prediction model to predict or exclude MASH.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,260
Score d'incertitude au seuil0,861

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle