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Enregistrement W4409585461 · doi:10.3390/ijms26083845

Insights into Active Site Cysteine Residues in Mycobacterium tuberculosis Enzymes: Potential Targets for Anti-Tuberculosis Intervention

2025· review· en· W4409585461 sur OpenAlexafffund
Abayomi S. Faponle, James W. Gauld, Sam P. de Visser

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2025
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensUniversity of WindsorMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCysteineActive siteBiochemistryMycobacterium tuberculosisEnzymeChemistryBiologyTuberculosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cysteine, a semi-essential amino acid, is found in the active site of a number of vital enzymes of the bacterium Mycobacterium tuberculosis (Mtb) and in particular those that relate to its survival, adaptability and pathogenicity. Mtb is the causative agent of tuberculosis, an infectious disease that affects millions of people globally. Common anti-tuberculosis targets are focused on immobilizing a vital cysteine amino acid residue in enzymes that plays critical roles in redox and non-redox catalysis, the modulation of the protein, enzyme activity, protein structure and folding, metal coordination, and posttranslational modifications of newly synthesized proteins. This review examines five Mtb enzymes that contain an active site cysteine residue and are considered as key targets for anti-tuberculosis drugs, namely alkyl hydroperoxide reductase (AhpC), dihydrolipoamide dehydrogenase (Lpd), aldehyde dehydrogenase (ALDH), methionine aminopeptidase (MetAP) and cytochromes P450. AhpC and Lpd protect Mtb against oxidative and nitrosative stress, whereas AhpC neutralizes peroxide/peroxynitrite substrates with two active site cysteine residues. Mtb ALDH detoxifies aldehydes, using a nucleophilic active site cysteine to form an oxyanion thiohemiacetal intermediate, whereas MtMetAP’s active site cysteine is essential for substrate recognition. The P450s metabolize various endogenous and exogenous compounds. Targeting these critical active site cysteine residues could disrupt enzyme functions, presenting a promising avenue for developing anti-mycobacterial agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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