Development and validation of KASP markers for a novel powdery mildew resistance gene in wheat using BSR-Seq analysis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Wheat powdery mildew occurs as a devastating infection caused by the pathogenic fungi Blumeeria graminis f. sp. tritici (Bgt). The management of disease becomes much more effective when host resistance methods are employed. The WL711-2U/2B line served as the introgressed line to identify genes linked with powdery mildew resistance. This allowed us to look into the potential resistance components in response to powdery mildew infection. The resistance status of the line towards powdery mildew developed from a single dominant gene named PmAT. Bulked segregant RNA-Seq (BSR-Seq) together with previous QTL-Seq SNP markers helped identify strong candidate regions in chromosome arm 2B extending from 531114848 bp to 530235618 bp. The LOD score from this region reached 72.4 with a PVE% of 64.7, thus proving its main role in resistance. The physical position was subsequently locked up, which was different from the previously identified genes on the same chromosome arm in its position, suggesting that it is most likely a new Pm gene . The QTL interval contained five potential genes that we identified during this research. The five candidate genes directs the protein production, which performs functions linked to the pentatricopeptide repeat family as well as B-box-type zinc finger domain, P-loop-containing nucleoside triphosphate hydrolase, and plant peroxidase. Highlight The identification of a new wheat powdery mildew resistance gene ( PmAT ) using a combination of BSR-Seq and QTL-Seq analysis, which located five candidate genes specifically on chromosome 2B.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».