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Enregistrement W4409603033 · doi:10.1101/2025.04.18.25326076

AutoReporter: Development of an artificial intelligence tool for automated assessment of research reporting guideline adherence

2025· preprint· en· W4409603033 sur OpenAlexaff
David Chen, Penghui Li, Ealia Khoshkish, Seungmin Lee, Tony Ning, Umair Tahir, Henry C. Y. Wong, Michael S.F. Lee, Srinivas Raman

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaMcMaster UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGuidelineComputer scienceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective To develop AutoReporter, a large-language-model system that automates evaluation of adherence to research reporting guidelines. Materials and Methods Eight prompt-engineering and retrieval strategies coupled with reasoning and general-purpose LLMs were benchmarked on the SPIRIT-CONSORT-TM corpus. The top-performing approach, AutoReporter, was validated on BenchReport, a novel benchmark dataset of expert-rated reporting guideline assessments from 10 systematic reviews. Results AutoReporter, a zerolZlshot, nolZlretrieval prompt coupled with the o3-mini reasoning LLM, demonstrated optimal accuracy (CONSORT: 90.09%; SPIRIT: 92.07%), run-time (CONSORT: 617.26 seconds; SPIRIT: 544.51 seconds), and cost (CONSORT: 0.68 USD; SPIRIT: 0.65 USD). AutoReporter achieved a mean accuracy of 91.8% and substantial agreement (Cohen’s κ>0.6) with expert ratings from the BenchReport benchmark. Discussion Structured prompting alone can match or exceed fine-tuned domain models while forgoing manually annotated corpora and computationally intensive training. Conclusion LLMs can feasibly automate reporting guideline adherence assessments for scalable quality control in scientific research reporting. AutoReporter is publicly accessible at https://autoreporter.streamlit.app .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,032
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,127
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,968
Score d'incertitude au seuil0,168

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0320,127
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0060,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0030,004
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0190,012

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,191
Tête enseignante GPT0,502
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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