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Enregistrement W4409616651 · doi:10.1101/2025.04.16.25325971

Cortical differences across psychiatric disorders and associated common and rare genetic variants

2025· preprint· en· W4409616651 sur OpenAlexafffund
Kuldeep Kumar, Zhijie Liao, Jakub Kopál, Clara Moreau, Christopher R. K. Ching, Claudia Modenato, William C. Snyder, Sayeh Kazem, Charles-Olivier Martin, Anne-Marie Bélanger, Valérie Fontaine, Khadijé Jizi, Rune Bøen, Guillaume Huguet, Zohra Saci, Leila Kushan, Ana Isabel Silva, Marianne B. M. van den Bree, David E.J. Linden, Michael J. Owen, Jérémy Hall, Sarah Lippé, Guillaume Dumas, Bogdan Draganski, Laura Almasy, Sophia I. Thomopoulos, Neda Jahanshad, Ida E. Sønderby, Ole A. Andreassen, David C. Glahn, Armin Raznahan, Carrie E. Bearden, Tomaš Paus, Paul M. Thompson, Sébastien Jacquemont

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthHelse Sør-Øst RHFInstitut de Valorisation des DonnéesCentre Hospitalier Universitaire VaudoisNational Institutes of HealthSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungCanada First Research Excellence FundNorges ForskningsrådSimons Foundation Autism Research InitiativeCanadian Institutes of Health ResearchNational Science FoundationCompute CanadaWellcome TrustEuropean CommissionNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFondation Brain CanadaHealth and Care Research Wales
Mots-clésGeneticsPsychiatryMedicinePsychologyBiologyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic studies have identified common and rare variants increasing the risk for neurodevelopmental and psychiatric disorders (NPDs). These risk variants have also been shown to influence the structure of the cerebral cortex. However, it is unknown whether cortical differences associated with genetic variants are linked to the risk they confer for NPDs. To answer this question, we analyzed cortical thickness (CT) and surface area (SA) for common and rare variants associated with NPDs, in ~33000 individuals from the general population and clinical cohorts, as well as ENIGMA summary statistics for 8 NPDs. Rare and common genetic variants increasing risk for NPDs were preferentially associated with total SA, while NPDs were preferentially associated with mean CT. Larger effects on mean CT, but not total SA, were observed in NPD medicated subgroups. At the regional level, genetic variants were preferentially associated with effects in sensorimotor areas, while NPDs showed higher effects in association areas. We show that schizophrenia- and bipolar-disorder-associated SNPs show positive and negative effect sizes on SA suggesting that their aggregated effects cancel out in additive polygenic models. Overall, CT and SA differences associated with NPDs do not relate to those observed across individual genetic variants and may be linked with critical non-genetic factors, such as medication and the lived experience of the disorder.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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